磷酸二酯酶2抑制剂的结构—活性关系研究 08月23日
【摘要】环腺苷酸cAMP和环鸟苷酸cGMP是具有细胞内信息传递作用的小分子,被称为细胞内第二信使,在新陈代谢,神经传递和细胞生长等多个方面起着重要的作用。cAMP和cGMP的细胞内的浓度水平由膜上的腺苷环化酶的合成和磷酸二酯酶的降解共同调控。磷酸二酯酶PDEs催化水解cAMP和cGMP,生成没有活性的AMP和GMP。磷酸二酯酶对细胞的生理过程具有重要的调控作用。在磷酸二酯酶超级家族11种基因家族中 […]
维吉尼亚链霉菌IBL14中氧甲基转移酶基因的鉴定和功能分析 05月27日
【摘要】维吉尼亚链霉菌IBL14(StreptomycesvirginiaeIBL14)为本实验室筛选出的有效的转化和降解甾醇类化合物茼株。前述研究证明IBL14菌株通过氧甲基转移酶使薯蓣皂素B环上发生甲氧基化形成6-甲氧基产物这一首次发现的甾体化合物的生物甲氧基化。本研究对IBL14菌株的全基因组进行测序,使用BLASTP工具分析测序结果,在IBL148.0Mb的线性染色体中筛选出9个氧甲基转移 […]
蛋白质—配体柔性对接相关计算问题研究 06月30日
【摘要】蛋白质与小分子对接技术是基于结构的药物设计的重要技术。早期的分子对接技术将蛋白质当作刚体,与小分子基于形状互补对接。然而很多蛋白质结构存在着或多或少的柔性,这种柔性在蛋白质分子执行其生物功能中发挥重要的作用,因此处理蛋白质结构柔性是分子对接领域一个重要的颇具挑战的问题。分子对接中另一个重要的问题是构象搜索算法。蛋白质分子的自由度极大,可能的构象数量是天文数字,因此必须使用优化的搜索策略。针 […]
二氢杨梅素对副溶血性弧菌的抑菌机理探讨 06月25日
【摘要】二氢杨梅素(DMY)是一种多酚羟基双氢黄酮醇,大量存在于葡萄科蛇葡萄属植物藤茶中,具有抗炎止痛及抗过敏、止咳祛痰、保肝护肝、降血糖、降血脂及抗脂质过氧化作用、抗菌、抗癌等生理活性。DMY作为一种具有广谱抗菌效果的黄酮类化合物,对杆菌或弧菌属具有很强的抑制作用。本课题通过DMY对几种常见的的食品致病菌进行抑菌实验研究,确定DMY的最低抑菌浓度,并以副溶血性弧菌主要对象、探讨DMY对其的抑菌特 […]
高效智能抗氧化硒酶的分子设计与理论研究 12月04日
【摘要】基于钙离子结合蛋白(recoverin)在结合钙离子(Ca2+)前后构象变化的特点,运用计算机模拟设计谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)催化中心,成功将recoverin别构效应与GPx酶催化功能相关联。通过结构分析Ca2+调控下模拟酶催化位点的“开关”状态,并研究活性“开启”状态下野生型recoverin及其突变体与GPx天然底物谷胱甘肽(GSH)的分子识别机制,为设计构筑高效智能抗氧化硒酶的 […]
拉伸分子动力学模拟研究Hsp31和底物的相互作用 09月11日
【摘要】Hsp31是一种常见于大肠杆菌的伴侣蛋白,能够防止细胞内的蛋白质在胁迫条件下发生错误的折叠与聚合。像DJ-1和YDR533Cp等蛋白一样,Hsp31也是DJ-1/ThiJ/Pfpl超家族成员之一。除了一直为人们所熟知的具有蛋白酶的活性以外,近来研究表明Hsp31对于乙二醛、甲基乙二醛等醛类也表现出了很好的催化活性。已有的研究表明,Hsp31家族的蛋白质依据超级结构的不同主要分为三种类型:第 […]
与酪氨酸酶相互作用蛋白的鉴定和作用机制研究 04月07日
【摘要】酪氨酸酶(EC1.14.18.1)是一种含铜离子的氧化酶,广泛存在于微生物、动植物及人体中。它是黑色素形成过程中起决定性作用的限速酶。酪氨酸酶的突变会导致毛发,皮肤,眼睛中的色素减退。酪氨酸酶在黑素体形成及黑色素细胞的凋亡调控中并不是独立发挥调控作用,而是需要同其他各种蛋白因子绑定形成蛋白质复合物共同进行调控。本课题目的在于发现新的与酪氨酸酶相互作用的蛋白质因子,阐明作用机制,对研究黑色素 […]
激酶双靶点抑制剂的设计及Ⅱ型抑制剂解离通路的研究 03月15日
【摘要】蛋白激酶是目前已知最大的蛋白超家族,518种激酶组成的约20多种激酶组占据人类基因组约1.7%的基因。激酶通过使ATP的γ磷酸基团转移到蛋白质底物上催化反应,从而参与调控多种重要的信号通路和细胞进程,包括翻译、增殖、分化、凋亡、新陈代谢、细胞周期和细胞骨架重组等。蛋白激酶的过度表达与多种疾病相关,如癌症高血压、帕金森氏病、炎症和自身免疫性疾病等。目前已有许多激酶药物通过FDA批准上市或已进 […]
基于蛋白激酶CK2和PAK4结构的小分子抑制剂的设计及筛选 03月08日
【摘要】蛋白激酶CK2和PAK4都是高度保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,它们与多种细胞活动密切相关并且在多种肿瘤中过度表达,已成为多种癌症治疗的重要靶点,因此,开发其小分子抑制剂具有重要意义。在本论文中,我们首先采用分子对接、分子动力学模拟以及结合自由能计算等计算方法研究了蛋白激酶CK2与其小分子抑制剂CX-4945及其一系列的衍生物间的相互作用。利用分子对接预测的结合构象,我们选取了10个小分子抑 […]
猪肝羧酸酯酶1水解磺胺类药物的特性研究 07月25日
【摘要】猪肝羧酸酯酶(Pigliveresterase,PLE),属于丝氨酸蛋白酶,是由多种同工酶组成的酶家族,其中猪肝羧酸酯酶1(PLE1)含量较高,是该家族的重要成员。PLE具有高度的水解活性和立体选择性,成为有机合成中主要的水解酶之一。但PLE作为药物代谢酶的角色,在猪的药物代谢和解毒中是否发挥作用尚未见报道。据其在有机化学合成中显示出的强大水解活性,以及人类CES显示出的重要药物代谢和解毒 […]