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基于蛋白激酶CK2和PAK4结构的小分子抑制剂的设计及筛选 03月08日

【摘要】蛋白激酶CK2和PAK4都是高度保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,它们与多种细胞活动密切相关并且在多种肿瘤中过度表达,已成为多种癌症治疗的重要靶点,因此,开发其小分子抑制剂具有重要意义。在本论文中,我们首先采用分子对接、分子动力学模拟以及结合自由能计算等计算方法研究了蛋白激酶CK2与其小分子抑制剂CX-4945及其一系列的衍生物间的相互作用。利用分子对接预测的结合构象,我们选取了10个小分子抑 […]

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极化电荷的发展、应用以及生物大分子体系分子动力学模拟的研究 10月13日

【摘要】分子动力学模拟可以用来研究生物大分子体系的各种性质,如:预测受体和配体之间的亲和力,模拟蛋白质的折叠过程,研究蛋白质与细胞膜之间的相互作用、离子通道以及酶的催化反应等等,因此逐渐受到科学家的重视。分子动力学模拟理论将每个原子看成一个球,原子与原子之间通过弹簧连接,模拟体系在高维的势能函数面上运动。目前,存在多种不同的势能函数,如:AMBER,CHARMM,OPLS等,所有的势能函数都可划分 […]

基于巨噬细胞移动抑制因子的药物设计和分子模拟研究 06月14日

【摘要】巨噬细胞移动抑制因子(Macrophagemigrationinhibitoryfactor,MIF)是一种重要的多功能蛋白质,既具有细胞因子的作用,又具有酶的作用。作为细胞因子,MIF是炎症效应的一种重要调节剂,又是先天性免疫响应的主要上游介导剂;在免疫体系中,MIF对糖皮质激素具有重要的反向调节作用。大量的研究表明,MIF直接影响正常细胞的分裂和瘤基因诱导的恶性转化,或间接通过调节机体 […]