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核酸分子折叠机制的模拟研究 09月25日

【摘要】核酸是生命体内的基本物质。在传统的中心法则中,DNA是遗传信息的主要载体,储存着生物体的遗传基因;以DNA为模板,生命体通过转录过程可以合成RNA;最后,转录形成的RNA在核糖体中翻译成为蛋白质,为生命活动提供必需的物质。随着对核酸分子研究的深入,中心法则也逐步完善。比如,研究发现RNA在逆转录酶的协助下可以做为模板逆转录DNA、RNA也可以以自身为模板进行复制等等。需要特别指出的是,近年 […]

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过渡金属管状纳米材料的受限生长和含线缺陷的低维BN与MoS_2纳米材料物性的数值模拟研究 09月21日

【摘要】随着纳米技术的迅速发展,新的低维纳米结构材料不断地被制备出来。它们有着许多不同于体材料的特异性质,在物理学、化学、材料科学、生命科学,以及纳米电子学和纳米技术等领域有着巨大的应用潜力。比如,金属管状纳米材料有着独特的光学和电学性质,在超大规模集成电路、纳米电子学、光导纤维和传感器等领域有广泛的应用前景。此外,单层二硫化钼、二硫化钨和二维六角硼氮片等类石墨烯结构材料本身就具有直接带隙,弥补了 […]

新型分子力场的发展及其在蛋白质折叠研究中的应用 08月24日

【摘要】第一个分子动力学模拟距今约37年,开启了生物物理“从结构到功能”的新纪元。分子动力学模拟在原子水平上揭示了生物分子随时间的动力学和热力学性质,为解释重要的生物现象,探索生物分子的作用机制、功能提供了一个强有力的工具。此外,分子动力学模拟也成为解释实验现象,揭示实验本质的一个重要补充手段。实验科学家已成功利用分子动力学模拟计算了氨基酸电离的电离常数,酶反应的能垒等诸多重要问题。目前,分子动力 […]

蛋白激酶B抑制剂的设计合成、生物活性测定、分子模拟研究及Biginelli反应研究 07月30日

【摘要】蛋白激酶B(PKB/Akt)作为良好的抗肿瘤药物靶点,已有多种PKB抑制剂被广泛研究并应用于肿瘤的治疗。其中ATP竞争性抑制,变构抑制剂,非ATP竞争性抑制剂和假底物抑制剂是当前研究最广泛的PKB抑制剂。但是由于PKB亚型之间及PKB与其它激酶间的氨基酸序列存在高度同源性,因此PKB抑制剂的选择性设计是PKB抑制剂研究领域的一个棘手的难题。蛋白激酶选择性抑制机理的研究可以为选择性抑制剂的设 […]

基于商品钢的淬火—分配组织结构演变与塑性变形行为 07月29日

【摘要】钢铁材料经淬火-分配(Q-P)处理可获得优异的综合力学性能。近年来,该工艺在基础理论和应用研究方面都取得了明显进展。目前应用研究主要集中于开发新一代先进高强度钢,对于传统钢的Q-P热处理强韧化研究比较匮乏。在理论研究方面,分配过程中奥氏体的富碳化机制、变形时残余奥氏体(RA)起作用的增塑机制等问题有待进一步深入和系统研究。本文选用商品化合金钢27SiMn,35CrMnSi,35CrMo,3 […]

卤、硫、氮族化合物分子间相互作用的理论研究 07月27日

【摘要】摘要:近年来,尽管分子间相互作用的研究已经取得了突飞猛进的发展,但是不同分子间二体和三体相互作用的氢键和卤键研究依然存在空白,而且卤键与氢键之间的协同性研究也还不够深入。因此,本文采用二阶微扰理论(MP2)从头算法对卤、硫、氮族化合物分子间相互作用的二体和三体的几何构型、相互作用能、卤键与氢键之间以及氢键之间的协同性进行了理论研究,并通过静电势分析和分子中的原子(AIM)分析对这些分子间相 […]

阴—非离子表面活性剂抗Ca~(2+)机理 07月16日

【摘要】阴-非离子表面活性剂相比于非离子表面活性剂和阴离子表面活性剂,具有耐盐性能好,kraff点低,浊点高以及环境友好的优点。研究发现,该类阴-非离子表面活性剂都有很高的抗Ca2+能力,认为分子中的EO基团会与Ca2+离子发生络合作用,从而减小了Ca2+离子对极性头基的影响,表面活性剂分子不容易沉淀,因此提高了其抗Ca2+离子能力。为了得到EO基团与Ca2+离子相互作用的大小、EO数量对这种相互 […]

含表面活性剂复配体系自组装机理的理论研究 07月11日

【摘要】诺贝尔获奖者Pierre-GillesdeGennens曾经指出:“离开表面活性剂,我们对90%的工业问题都将无能为力(withoutsurfactants,wewouldbecompleltelyunabletoconfront90%industrialissues)”.实践表明,单一表面活性剂的效果常常不及混合物。将表面活性剂与聚合物或者不同类型的表活性剂按适当条件复配,可 […]

高分子链在纳米体系表面取向行为的分子动力学模拟 07月05日

【摘要】高分子复合材料中添加的无机物或有机物影响着高分子的聚集态,而高分子的聚集态又决定着复合材料的性质。实验上对于复合材料的研究主要集中于观察复合材料形貌的变化和添加的填料的多少对于复合材料宏观性质的影响,但要提供相应微观机理的描述比较困难。因此本文运用分子动力学的方法模拟研究高分子链在纳米体系表面的取向行为,理解高分子复合材料界面间的非键相互作用,并通过研究二氧化硅、金纳米线表面对聚乙烯取向行 […]

基于巨噬细胞移动抑制因子的药物设计和分子模拟研究 06月14日

【摘要】巨噬细胞移动抑制因子(Macrophagemigrationinhibitoryfactor,MIF)是一种重要的多功能蛋白质,既具有细胞因子的作用,又具有酶的作用。作为细胞因子,MIF是炎症效应的一种重要调节剂,又是先天性免疫响应的主要上游介导剂;在免疫体系中,MIF对糖皮质激素具有重要的反向调节作用。大量的研究表明,MIF直接影响正常细胞的分裂和瘤基因诱导的恶性转化,或间接通过调节机体 […]