马氏珠母贝SNP标记开发与其生长性状的关联分析

【摘要】马氏珠母贝是用来培育和生产海水珍珠的主要贝类,是我国海洋经济的重要组成部分。本研究利用马氏珠母贝参考基因组中与生物矿化相关的基因,开发SNP标记,分析马氏珠母贝生长性状以及珍珠质层厚度与矿化基因位点的基因型的相关性,意在探索基因型对表型性状的影响,为马氏珠母贝的分子标记辅助育种以及重要生长性状的QTL定位提供一定的依据。本研究得到以下结果：1.利用马氏珠母贝参考基因组,找出了5可能的SNP位点,在SNP位点上下游设计引物,用10个个体测序检测SNP位点的真实性和多态性。经后续实验从中筛选出3个SNP位点。Prismalin-1、N19和MSI60三个引物适合采用Tm-shift法,每个位点的两个特异性引物一个为添加长尾的正向引物,一个为添加短尾的正向引物。2.8个家系的基因分型结果表明MSI60基因的SNP位点多态性较低,在CB、CH和CJ三个家系中无多态性；3.采用Pearson对样品进行关联分析,N19基因的SNP位点与样品的壳高之间存在显著相关性(P=0.046)；Prismalin-14基因的SNP位点与家系CN中5个性状均具显著相关性(P<0.05)；N19基因的SNP位点与CF家系的壳高、壳宽和总重,与CG家系的壳高性状,与CH家系的五个生长性状以及CP家系的壳长、绞合线长壳宽和总重四个性状均呈显著相关性(P<0.05)；但是MSI60基因的SNP位点由于多态性较低,并未发现SNP位点与生长性状之间的相关性。4.采用Pearson目关性分析3个基因与贝壳珍珠质层厚度之间的相关性,其中Prismalin-14基因的SNP位点在CA、CG和CN家系中与贝壳珍珠质层厚度呈显著相关性(P<0.05)。N19和MSI60基因的SNP位点在采集的8个家系中均无显著相关性。本研究对于马氏珠母贝的育种研究属于基因研究层面,旨在改善马氏珠母贝的生长和珍珠质层的形成能力。SNP位点的开发,对于马氏珠母贝养殖上的应用将变得非常重要,可用于马氏珠母贝的种质鉴定、分子遗传学分析和野生资源保护等方面的研究。为马氏珠母贝的QTL(QuantitativeTraitLocus,数量性状基因座)定位提供一定的依据。
【作者】温海洋；
【导师】王爱民；
【作者基本信息】海南大学，水产养殖学，2014，硕士
【关键词】马氏珠母贝；基因分型；单核苷酸多态性(SNP)；生长性状；贝壳珍珠质层厚度；

【参考文献】
[1]李鹏飞.HPV38 E6/E7对角质形成细胞自噬的影响及机制探讨[D].第四军医大学,皮肤病与性病学,2014,硕士.
[2]李雪莹.山西朔州秧歌戏的民俗意蕴研究[D].山西师范大学,民俗学,2013,硕士.
[3]张凤.文化敏感性教学的研究[D].华中师范大学,教育学原理,2013,硕士.
[4]周静言.后危机时代俄罗斯产业政策调整研究[D].辽宁大学,转轨经济学,2014,博士.
[5]侯俊霞.转盘过滤器流场模拟及结构研究[D].北京化工大学,化工过程机械,2013,硕士.
[6]武钢,罗学恕,陈书瀚,郑孝天,何映清,严发志.浇铸钢流测温的新方法[J].冶金自动化,1980,06:52-53.
[7]刘忠,罗浩,薛锋,任雄伟.二进制检测声音传感器网络协作检测效能研究[J].控制与决策,2012,06:945-948.
[8]徐俊毅.认知与情感信任的前因及对顾客忠诚的影响[D].浙江工业大学,2007.
[9]王小艳.我国上市商业银行股权结构与治理风险关系的实证研究[D].西北大学,国民经济学,2014,硕士.
[10]谢小超.一例急性间歇性卟啉病的家系调查及文献复习[D].大连医科大学,内科学,2012,硕士.
[11]曹永岩.浅析入侵检测技术[J].龙岩师专学报,2004,03:18-22.
[12]董其军.一种以用户为中心的智能化数字图书馆系统[J].四川图书馆学报,2002,02:24-28.
[13]郑炯.高中写作教学策略研究[D].华东师范大学,教育,2001,硕士.
[14]黄潇.民营上市公司治理与成长性的实证研究[D].首都经济贸易大学,会计学,2013,硕士.
[15]陈江峰.国际奥委会的法律性质及运作规则初探[D].外交学院,国际法,2004,硕士.
[16]王明亮.基于Android的机顶盒关键技术研究[D].华中科技大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[17]胡建安.层间隔震加消能减震框架结构的抗震性能分析[D].安徽建筑工业学院,结构工程,2012,硕士.
[18]杨海霞.姜黄素对卵巢癌细胞EGFR表达及凋亡的影响[D].青岛大学,中西医结合临床,2013,硕士.
[19]兰羽.具有温度补偿功能的超声波测距系统设计[J].电子测量技术,2013,02:85-87.
[20]陈玉福,董鸣.毛乌素沙地群落动态中克隆和非克隆植物作用的比较[J].植物生态学报,2002,03:377-380.
[21]董丽.钛表面接枝RGD及装载BMP的仿细胞外间质聚多糖自组装膜制备与表征[D].西南交通大学,材料工程,2014,硕士.
[22]高丹丹.汉语佛源词语语义嬗变及动因研究[D].渤海大学,语言学及应用语言学,2014,硕士.
[23]杨芳.吉林省民生经济发展研究[D].吉林财经大学,应用统计,2013,硕士.
[24]曹淑敏.第三代移动通信的发展现状与趋势[J].当代通信.2004(10)
[25]高越.名中医专家知识发现与推理应用算法研究[D].燕山大学,生物医学工程,2014,硕士.
[26]宋　罡１,韩　意２.基于装备制造业产业集群的辽宁区域品牌建设研究[J].沈阳工业大学学报(社会科学版).
[27]岑益科.基于机器视觉的鸡蛋品质检测方法研究[D].浙江大学,2006.
[28]王婧.惊奇感对事后聪明式偏差三成分的影响[D].西南大学,发展与教育心理学,2013,硕士.
[29]崔文健.乡镇河道景观规划设计研究与实践[D].南昌大学,园林植物与观赏园艺,2014,硕士.
[30]陈建华.我国典型贝类增养殖海域藻毒素组成、分布状况及贝类染毒特征分析[D].中国科学院研究生院（海洋研究所）,环境工程,2013,硕士.
[31]谭军.EJB服务器命名服务的实现[D].南京航空航天大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[32]尤作赛.基于动态污点分析的恶意代码行为依赖图挖掘技术的研究与实现[D].国防科学技术大学,软件工程,2012,硕士.
[33]浩布尔.评《道连·格雷的画像》中的唯美主义[D].辽宁大学,英语语言文学,2012,硕士.
[34]磨琪卉.我国货币政策调控房价有效性研究[D].北京林业大学,金融学,2013,硕士.
[35]刘靖姝.不同焦虑类型高校毕业生职业未决的比较及其与职业决策自我效能感的关系[D].西南大学,发展与教育心理学,2013,硕士.
[36]赵瑾.电催化高级氧化技术处理冲厕海水研究[D].天津大学,2012.
[37]顾金芳.圆锥滚子轴承动力学仿真分析[D].河南科技大学,机械设计及理论,2013,硕士.
[38]李江飞.基于贝叶斯网络的地铁项目施工风险评价研究[D].哈尔滨工业大学,管理科学与工程,2013,硕士.
[39]蒋美红.大学生思想政治教育中的激励方法研究[D].北京化工大学,思想政治教育,2013,硕士.
[40]胡皓月.自伤大学生的自我图式研究[D].华中师范大学,应用心理学,2014,硕士.
[41]丘士丹.某商业银行加拿大子行存款业务系统的设计与实现[D].吉林大学,软件工程,2014,硕士.
[42]张丽萍.试论我国农村法律援助制度的完善[D].山东大学,法律（专业学位）,2013,硕士.
[43]杨柳.视网膜新生血管动物模型的制作及血管内皮生长因子的表达[D].青岛大学,眼科学,2003,硕士.
[44]詹存卫,于丹,吴中华,刘春花,李中强.梁子湖水-陆交错区水生植物群落生态学研究[J].植物生态学报,2001,05:573-580.
[45]杜卉.高层住宅小区架空层空间应用与景观设计研究[D].苏州大学,园林植物与观赏园艺,2013,硕士.
[46]杨媛珺.北京市公共自行车系统运营模式研究[D].北京交通大学,2014.
[47]孙达亮.躯体形式障碍和广泛性焦虑障碍脑葡萄糖代谢改变的PET显像研究[D].复旦大学,精神病与精神卫生学,2013,博士.
[48]郭雷勇.基于Java的WebGIS技术研究和实现[D].武汉理工大学,信号与信息处理,2004,硕士.
[49]巫世瑶.从T辅助细胞的分化探讨胆碱能抗炎通路对类风湿关节炎的保护作用机制[D].中南大学,临床医学,2014,博士.
[50]朱雷坚.基于Android的实时语音通信系统的设计与实现[D].浙江工业大学,2013.