【摘要】本文总结了生物学数据集成研究的现状,对代谢通路数据集成和自动模式匹配的集成方法做了深入的研究和探讨,并结合两者提出了一种全新的基于相似性推导的代谢通路数据集成方法。在此基础上,采用了动态布局的可视化用户界面,建立起一个完整的代谢通路数据集成系统。(1)提出了一种基于相似性推导的代谢通路数据集成方法通过对代谢通路数据特点的分析,结合模式匹配研究中基于结构水平的匹配方法,将Similarity […]

【摘要】由于生物科学和互联网的飞速发展,生物信息数据不断壮大,自然科学研究中的首要课题将是运用生物学和计算机科学的知识研究其中所包含的生物信息以及探索生物的内在发展规律。面对大量的生物资源,网络的日益复杂,传统的生物信息网站已经无法迅速掌握最新最准确的生物数据,以及无法将数据分析与数据管理集合到一起进行研究讨论。因此需要一种有效的方法对其进行相应的管理和维护,以便可以进一步将数据分析、处理和利用在 […]

【摘要】本文利用生物信息学手段,对植物特异的转录因子蛋白家族、RNA介导的DNA甲基化通路和长非编码RNA的发掘和研究进行了深入研究。第一部分主要利用生物信息手段对多个全基因组数据进行挖掘,从序列分析、基因结构和系统进化树等方面对植物特有的TIFY转录因子家族进行分析。通过对14个基因组的挖掘,鉴定了TIFY家族的全部成员,并根据结构域构成将它们分成四个不同的亚家族TIFY,PPD,JAZ和ZML […]

【摘要】大量的生物文本为生物医学研究提供了丰富的资源。但由于文本数量巨大，无法通过人工处理来获取信息。文本挖掘能从现有的文献中自动地挖掘感兴趣的信息。借助于文本挖掘，可以从文献数据库检索需要的生物医学文本；这些非结构化的文本包含了大量的研究成果和实验数据，文本挖掘可以找出其中蕴含的重要信息和知识；在所发现的信息的基础上，研究人员可以进一步生成假设、进行推断和预测、指导实验和更深入的研究。癌症已经成 […]