【摘要】本研究采用2011年构建的大鳞副泥鳅混合群体，进行二代测序，获得SNP标记信息，通过PCR-SSCP验证，筛选得到可用的SNP标记；利用筛选的SNP标记对2013年构建的3个大鳞副泥鳅家系进行遗传结构分析，并进行了SNP标记与生长性状相关性分析，为大鳞副泥鳅的分子育种提供一定的技术支撑。主要结果如下：1、基于第二代测序的大鳞副泥鳅SNP标记的开发通过IlluminaHiSeq2000测序平 […]

【摘要】花青素作为一种天然的植物色素,具有很高的保健作用。花青素的生物合成及调控基因在玉米、矮牵牛、拟南芥等植物中有较深入的研究,但是在生菜中的报道相对较少。为了定位克隆生菜中控制叶紫色性状的基因,本研究对紫色生菜和绿色油麦菜进行杂交构建了叶色分离的F2代群体。从F2群体中选取50株颜色最深的建立一个混合池–紫色池,50株绿色F2植株建立绿色池。对两个极端池的叶片样本进行RNA-seq […]

【摘要】细菌作为地球上最古老的物种之一,具有比真核生物更简单的细胞结构和独特的遗传物质组织调节方式。作为遗传学上经典的模式生物,大肠杆菌的染色体以1000倍以上的比例压缩凝聚在细胞中,与细胞中的蛋白质,RNA等共同构成拟核结构。近年来的研究表明细菌染色体并不是像人们过去认为的那样杂乱的压缩在拟核区域内,而是有着一定的层次,经过有序地包装,组织来形成高级结构。细菌基因组中被同一个转录因子调节的操纵子 […]

【摘要】生物信息学是一门新兴的交叉学科,它利用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法来研究和解决生物学的问题。当前生物信息学所研究的问题主要集中在分子生物学领域,其中一个非常重要而又极具挑战性的问题就是转录组的从头拼接,即利用转录组的测序片段来拼接出整个转录组中的所有表达的转录体。本文主要研究如何利用经典的组合优化模型来解决复杂真核生物转录组的从头拼接问题,这对于研究包括癌症在内的许多与可变剪接相 […]