大豆脂肪酸组成性状全基因组关联分析

【摘要】大豆是世界范围内重要的油料作物,其产量占世界油料作物产量的39%,为人类提供主要的食用油,其脂肪酸配比对大豆油的品质具有重要影响,因而对大豆脂肪酸的遗传研究具有重要的意义。大豆脂肪酸组成性状遗传研究主要是利用双亲分离群体的连锁分析和利用少量分子标记的关联分析。为克服其缺陷,有必要利用海量分子标记进行全基因组关联分析。为此,本研究首先以不同生态区的285份大豆品种作为试验群体,利用全基因组的84443个SNP标记信息,通过TASSEL软件的混合线性模型(MLM)方法,对大豆5种主要脂肪酸组成性状进行全基因组关联分析；然后,利用生物信息学方法,借助关联标记与大豆基因组信息,获得与大豆脂肪酸组成性状的候选基因。主要结果如下：1、在-log10P≥3水平下,2011和2012年分别检测到654和558个大豆脂肪酸相关的QTL,其中棕榈酸检测到111和41个、硬脂酸检测到47和52个、油酸检测到147和110个、亚油酸检测到138和140个、亚麻酸检测到211和215个。两年共检测到867个QTL；两年重复检测到206个,其中棕榈酸5个、硬脂酸1个、油酸65个、亚油酸65个和亚麻酸70个。与两个以上性状关联标记在2011年有112个,2012年有73个。这867个QTL在20条染色体上有分布频率依次为0.62、0.83、1.60、0.63、1.30、0.99、1.22、1.07、1.07、0.61、0.64、0.90、0.81、1.20、0.60、1.93、0.93、0.79、0.59和0.82个/Mb。虽然在第3和16染色体上相对较多,但是基本呈均匀分布。2、检测到的关联标记附近共有1269个基因,其中175个基因内部有191个关联标记。这1269个基因中与拟南芥脂质代谢相关基因同源的基因有94个,其中17个基因内部有26个关联标记,80个基因旁边有152个关联标记,3个基因内部及旁边都有关联标记。与前人脂肪酸定位结果柑距500Kb以内的关联标记共61个,其中10个关联标记旁边有7个大豆同源脂质相关基因,9个关联标记在8个大豆基因的内部。
【作者】韩世凤；
【导师】章元明；
【作者基本信息】南京农业大学，作物遗传育种，2013，硕士
【关键词】大豆；脂肪酸；全基因组关联分析；脂质相关基因；

【参考文献】
[1]杨鹏飞.基于FPGA的网络打印安全体系结构研究与系统设计[D].西安电子科技大学,计算机系统结构,2011,硕士.
[2]郝兴明,陈亚宁,李卫红,郭斌,赵锐锋.胡杨根系水力提升作用的证据及其生态学意义[J].植物生态学报,2009,06:1125-1131.
[3]熊贤祝.多指标稳定分量过程和可加稳定分量过程的局部时[D].福建师范大学,概率论与数理统计,2004,硕士.
[4]宋洪磊,吴俊勇,郝亮亮.考虑同调约束的电力系统主动解列断面的搜索方法[J].电力系统自动化,2014,14:49-54+61.
[5]白彦.呼伦贝尔沙地植被覆盖度变化遥感监测研究[D].内蒙古农业大学,森林经理学,2013,硕士.
[6]陈海平.高速铁路乘务组织理论与优化研究[D].北京交通大学,2013.
[7]刘倩倩.高中数学新手教师课程认同的个案研究[D].西北师范大学,课程与教学论,2013,硕士.
[8]黄伟峰.基于模糊数学中S型隶属函数的风险度量VaR[D].中国地质大学（北京）,应用数学,2013,硕士.
[9]杨红梅.安阳木版年画收藏展示现状调查研究[D].郑州大学,文物与博物馆（专业学位）,2013,硕士.
[10]刘爱荣,周文.石墨烯基金属氧化物纳米复合结构材料的制备及应用于水体中污染物的吸附研究进展[J].科学通报,2014,21:2039-2054.
[11]刘维喜.枯草芽孢杆菌利用葡萄糖和木糖生产3-羟基丁酮的研究[D].天津大学,生物化工,2013,硕士.
[12]潘丽群.贵州区域经济空间竞合关系研究[D].贵州财经大学,区域经济学,2013,硕士.
[13]项闯.施工企业工程项目协同管理系统研究[D].浙江大学,2010.
[14]王晶.龙牙楤木叶总皂甙对肿瘤细胞凋亡及p53基因表达影响的实验研究[D].黑龙江中医药大学,中西医结合基础,2004,硕士.
[15]黄洋.BGP协议收敛性算法研究及并行化设计[D].西安电子科技大学,计算机软件与理论,2011,硕士.
[16]孙永昌.木质素高效分离、结构表征及基于离子液体的降解机理研究[D].北京林业大学,林产化学加工工程,2014,博士.
[17]夏和平.Honeywell9000系列小型集散控制系统在板坯连铸机上的应用[J].冶金自动化,1993,06:15-18+55.
[18]刘正.多孔碳非贵金属复合材料在电催化氧还原和锂硫电池中的应用研究[D].温州大学,2013.
[19]刘琳.世界银行天津市交通项目的环境影响分析与研究[D].天津大学,工商管理,2004,硕士.
[20]蒲德祥.基于素质的知识型员工绩效研究[D].贵州师范大学,基础心理学,2004,硕士.
[21]姜义军.浦东铁路开行市郊列车的客流需求研究[J].城市轨道交通研究.2008(02)
[22]胡鹏.互联网侧智能管道控制平台的研究[D].浙江工业大学,2013.
[23]刘玉杰.利用新型全自动太阳光度计研究气溶胶光学和物理特性[D].南京气象学院,气象学,2004,硕士.
[24]黄文福.甘肃民勤半荒漠地区荒漠藻生长条件优化研究[D].兰州理工大学,生物化学与分子生物学,2014,硕士.
[25]安森建,黄琳.混合不确定系统的鲁棒稳定性[J].自动化学报,2001,02:145-151.
[26]林夕伟.基于本体论的E-MAIL分类方法[J].浙江教育学院学报,2005,02:63-68.
[27]姬永强.硬目标侵彻测试系统防护设计与仿真分析[D].西南交通大学,工程力学,2013,硕士.
[28]蔡希玲.俞氏子波在地震数据处理中的应用研究[J].石油地球物理勘探,2000,04:497-507+544.
[29]赵南英.广州轨道交通通信骨干传输网及其展望[J].现代城市轨道交通.2007(02)
[30]李海英.基于可比价IO-SDA模型的我国二氧化碳强度研究[D].西南财经大学,统计学,2014,博士.
[31]李旸.日本留学生习得汉语形容词重叠式的偏误研究[D].湖南师范大学,对外汉语,2013,硕士.
[32]赵娜娜.泛在信息环境下公共图书馆服务层次构建[D].华中师范大学,图书馆学,2014,硕士.
[33]吕伟锋.无线旁路接入桌面电话[D].浙江大学,电路与系统,2004,硕士.
[34]孙国红.基于MPEG-4的视频水印技术研究[D].西安电子科技大学,计算机系统结构,2011,硕士.
[35]赵澜.具有两亲结构的荧光探针在分子有序组合体中的应用研究[D].长安大学,材料学,2013,硕士.
[36]韩程.中韩高校本科陶艺专业教育比较研究[D].景德镇陶瓷学院,设计艺术学,2014,硕士.
[37]官书云.论单位犯罪的本质[D].华中科技大学,经济法学,2013,硕士.
[38]马妍如.双边市场的捆绑销售策略研究[D].首都经济贸易大学,产业经济学,2014,硕士.
[39]张波.微流体DPIV技术及其在油液污染实时分析中的应用研究[D].南京航空航天大学,载运工具运用工程,2004,硕士.
[40]李建.n个斑块间具有路途感染的疾病传播模型[D].西南大学,应用数学,2013,硕士.
[41]段继光.基于LBS的个人监控服务系统的研究和实现[D].河北师范大学,计算机应用技术,2014,硕士.
[42]魏健.高压氧对大鼠脑脓肿周围水肿脑组织AQP-4表达影响的研究[D].吉林大学,临床医学,2013,硕士.
[43]段翠清.保护性耕作对黄土高原旱作农田土壤温室气体排放通量的影响[D].甘肃农业大学,生态学,2013,硕士.
[44]刘波,付丁强,牛明明,部美玲,黄文胜.1-(2-吡啶偶氮)-2-萘酚修饰玻碳电极阳极溶出伏安法测定痕量汞[J].湖北民族学院学报(自然科学版),2014,01:57-59.
[45]王景霞.软土卸荷过程孔隙结构分形演变及损伤定量研究[D].湖北工业大学,岩土工程,2014,硕士.
[46]孙燕芳.低Pt燃料电池催化剂的研究[D].青岛科技大学,2014.
[47]李翠娟.呼吸系统常见疾病合并低钠血症的临床观察[D].吉林大学,临床医学,2014,硕士.
[48]王泽富.制造业企业财务风险研究[D].宁波大学,工商管理（专业学位）,2014,硕士.
[49]杨涛.肺动脉高压患者右心功能与预后的评价[D].北京协和医学院,内科学,2014,博士.
[50]程效东.城市土地集约利用及其潜力评价研究——以马鞍山市为例[D].南京农业大学,2004.