胰阔盘吸虫分子种系发生的研究

【摘要】胰阔盘吸虫（Eurytremapancreaticum）主要寄生于牛、羊等反刍动物的胰脏、胰管内，破坏动物的胰腺或阻塞胰管，引起胰阔盘吸虫病。动物感染后会出现消瘦、贫血、水肿及消化功能障碍，导致生产性能下降，严重感染者会引起死亡。胰阔盘吸虫病呈全球分布，对反刍动物危害严重，给畜牧业生产造成较大的经济损失。另外，胰阔盘吸虫还可寄生于人，是一种重要的人兽共患病病原。目前对胰阔盘吸虫的研究主要集中在虫体形态结构、发育过程及胰阔盘吸虫病的流行病学、诊断和综合防治等传统寄生虫学方面；在分子水平上仅对核糖体18S和小RNA进行了研究，对核糖体全序列和线粒体全基因组的研究还未见报道。因此，本研究针对这一空白展开研究。首先，利用分子生物学方法，获得5条胰阔盘吸虫的核糖体全序列，对5个核糖体全序列的大小、基因组成、碱基组成等进行分析，并基于18S核糖体序列构建系统发生树，分析胰阔盘吸虫与其他吸虫间的进化关系。其次，扩增胰阔盘吸虫的线粒体全基因组，对全基因组进行序列分析，构建系统发生树，探讨胰阔盘吸虫在吸虫中的系统发生位置。结果表明：扩增获得的5个核糖体全序列长度为8306~8310bp，包括18S，ITS1，5.8S，ITS2，28S和IGS。5条虫体18S、ITS1、5.8S、ITS2、28S的长度均无变化，分别为1996bp、1103bp、160bp、231bp和3669bp，IGS长度只有四个碱基的变化，为1147~1151bp。比较发现6段核糖体序列的种内差异分别为0.1~0.4%、0~0.5%、0%、0%、0~0.2%和2.9~20.2%。以18S核糖体序列为标记基因，采用MP、ML和BI三种方法构建系统发生树的结果相似，胰阔盘吸虫位于斜睾目的进化分支上，与传统形态学分类一致，说明18S核糖体序列是研究寄生虫分子种系发生的良好基因标记。所获得的线粒体全基因组由12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和2个非编码区组成，线粒体全基因组大小为15169bp，编码蛋白质基因、rRNA基因和非编码区序列长分别为10121bp，1746bp和1281bp。整个线粒体基因组核苷酸组成为：A=17.96%，C=11.13%，G=26.21%，T=44.52%，A+T占62.48%，基因组碱基组成明显偏好碱基A和T。胰阔盘吸虫的基因排列（含tRNA）属GO1型。以串联的线粒体12个蛋白质编码基因为基因标记，采NJ、MP和ML法构建系统发生树的结果相似，进化树分为二个大的分支，枭形目为一分支，后睾目、棘口目和斜睾目为另一分支。胰阔盘吸虫位于斜睾目独立的进化分支上。此结果与以18S核糖体序列为标记基因构建的进化树结果相似，说明线粒体全基因序列是研究寄生虫分子种系发生的良好基因标记。通过本研究，首次获得了胰阔盘吸虫核糖体全序列和线粒体全基因组，并对它们的特征进行了分析，丰富了吸虫核糖体全序列和线粒体全基因组资料，基于核糖体和线粒体基因构建的系统发生树从分子水平上探讨了胰阔盘吸虫及其他吸虫的进化关系。
【作者】郑旭；
【导师】王春仁；
【作者基本信息】黑龙江八一农垦大学，预防兽医学，2014，硕士
【关键词】胰阔盘吸虫；核糖体全序列；线粒体全基因组；种系发生；

【参考文献】
[1]范文田.《石油地球物理勘探》第三次入选为全国中文核心期刊[J].石油地球物理勘探,2001,01:50.
[2]曹伊琳.基于H.264压缩域的电子稳像算法的研究[D].复旦大学,计算机技术,2012,硕士.
[3]江琼花.基于压缩感知的图像目标重构[D].西安电子科技大学,电路与系统,2012,硕士.
[4]宫淑清.财经类高校学分制改革研究[D].山西财经大学,教育经济与管理,2014,硕士.
[5]单悦.CSFV免疫猪接种PRRSV nsp2Δ1882-2241弱毒疫苗后IL-10、IL-12、TNF-α的应答特点研究[D].吉林大学,临床兽医学,2013,硕士.
[6]盛开俊.山东省高校体育教育专业乒乓球专选人才培养方式的研究[D].首都体育学院,运动训练,2013,硕士.
[7]张瑞青.体重因素对妊娠期高血压疾病发病的影响[D].郑州大学,妇产科学,2012,硕士.
[8]张文婷.基层公务员行政责任问题研究[D].山东大学,公共管理（专业学位）,2013,硕士.
[9]罗新星,彭久生.基于粗糙集理论的数据挖掘方法在电子商务中的应用[J].科技情报开发与经济,2003,07:175-177.
[10]唐世渭.SAS数据仓库解决方案[J].金融电子化,2001,09:75-77.
[11]黄丹.典型零售企业电子商务解决方案及其实现技术[D].南京工业大学,2003.
[12]章恬.中国生物质能开发利用的政策法律研究[D].中国地质大学（北京）,环境与资源保护法学,2013,硕士.
[13]李传荣,许景伟,宋海燕,李春艳,郑莉,王卫东,王月海.黄河三角洲滩地不同造林模式的土壤酶活性[J].植物生态学报,2006,05:802-809.
[14]李妍.中国微电影广告与品牌传播[D].苏州大学,传播学,2014,硕士.
[15]韩秋俊.基于鳖甲功效的先导化合物的发现研究（二）[D].北京中医药大学,中药化学,2013,硕士.
[16]陈苗,王瑞剑,陈依梦,马婷.网络购物中利益相关方的法律关系探讨[J].现代物业(中旬刊),2013,12:34-36.
[17]黄美善.构建舌癌干细胞富集模型及癌干细胞相关标志物CXCR4的检测[D].广西医科大学,口腔医学（专业学位）,2013,硕士.
[18]刘飞.锑基纳米线阵列可控制备与电化学性能研究[D].合肥工业大学,2012.
[19]茹甜甜.零售商主导的供应链竞争模型与契约协调研究[D].哈尔滨理工大学,管理科学与工程,2012,硕士.
[20]陈雪梅.家蚕核型多角体病毒ORF79基因（bm79）的结构和蛋白互作分析[D].西南大学,细胞生物学,2013,硕士.
[21]胡锦文.类桁架点阵夹芯结构优化设计与缺陷分析[D].哈尔滨工业大学,工程力学,2013,硕士.
[22]唐家琴.工业类ST股票投资价值评价及投资策略研究[D].南昌大学,企业管理,2012,硕士.
[23]王越,王鹏,陈春英,赵宇亮.碳纳米管呼吸系统毒性作用机制及其影响因素的研究进展[J].科学通报,2013,21:2007-2020.
[24]杨守恩.社会公正领导理论研究[D].南京师范大学,教育经济与管理,2012,硕士.
[25]王树勋,梁应敞.GM-RC,AJ-RCFIR系统辨识方法的改进[J].自动化学报,1992,04:470-474.
[26]张振宇.多井约束地震反演在储层描述中的应用研究[D].中国海洋大学,地质工程,2003,硕士.
[27]姚佐周.依靠科技进步,摆脱铁路困境[J].科技导报.1991(01)
[28]孙成禹,宫同举,张玉亮,张文颖.波动方程有限差分法中的频散与假频分析[J].石油地球物理勘探,2009,01:43-48+130+5+4.
[29]万承凤.DSCT双能量技术在痛风性关节炎诊断中的初步应用[D].福建医科大学,影像医学与核医学,2014,硕士.
[30]孔辉.基于Polar码的协作编码和分集技术研究[D].南京邮电大学,信号与信息处理,2013,硕士.
[31]何金斌.《墨子》城守诸篇军事信息传播探析[D].吉林大学,中国古代史,2014,硕士.
[32]赵祥理.钛酸铋钠—钛酸钡基无铅铁电陶瓷[D].浙江大学,材料学,2014,硕士.
[33]李嘉.基于语义的林产品贸易Web信息抽取研究[D].北京林业大学,管理科学与工程,2013,硕士.
[34]陈涛.我国当前高校通识教育实践的困境及出路[D].首都师范大学,教育学原理,2013,硕士.
[35]黄珊.二手房市场的交易信息成本研究[D].华中师范大学,产业经济学,2012,硕士.
[36]薄海军.甘肃陇南安房坝金矿成因矿物学研究与深部远景评价[D].中国地质大学（北京）,矿物学、岩石学、矿床学,2014,硕士.
[37]吴一梅.30MW太阳能冷热电联供系统研究[D].华中科技大学,制冷与低温工程,2012,硕士.
[38]黄博,李玲,凌道盛,陈星耀.G_(max)附加衰减模式及其对场地地震响应影响[J].浙江大学学报(工学版),2014,07:1170-1179.
[39]佟平,赵焰,吕宜延,佟怡,田竞.电子商务革命的三个阶段(下)[J].互联网周刊.2000(14)
[40]吴亚萍.清化饮联合三联疗法根除治疗Hp感染的临床观察[D].福建中医药大学,中西医结合临床（专业学位）,2013,硕士.
[41]任照松,印润远.基于统计方法的入侵检测模型[J].上海水产大学学报,2005,02:220-224.
[42]徐丹.改性温敏水凝胶对疏水性有机污染物的吸附去除[D].浙江大学,应用化学,2014,硕士.
[43]吴瑕.后现代女权主义的伦理审视[D].西南交通大学,伦理学,2012,硕士.
[44]李红梅.农行佛山分行信贷营销策略研究[D].西南交通大学,2005.
[45]王栋.苯并异噻唑啉酮类化合物及其糖苷类生物试剂的合成研究[D].西北师范大学,有机化学,2013,硕士.
[46]杨晋宇.我国企业跨国并购影响因素分析[D].云南财经大学,国际贸易学,2014,硕士.
[47]胡北.马德罗政治思想及实践雏议[D].中国社会科学院研究生院,世界史,2003,硕士.
[48]徐程程.可磁分离二氧化钛光催化剂的制备及其光催化活性的研究[D].华东理工大学,2013.
[49]姚迪.光照和可溶性糖处理对青花菜保鲜效果及其机理研究[D].南京农业大学,食品工程,2013,硕士.
[50]陈士辉.脑电信号中参考信号的研究与应用[D].杭州电子科技大学,计算机应用技术,2014,硕士.