应用SSR和SRAP技术研究广西柑橘资源遗传多态性

【摘要】柑橘是世界第一大水果,在中国柑橘栽培面积和产量均高居世界第一,在国内也是仅次于苹果的第二大水果。中国作为柑橘的起源中心之一,不仅拥有丰富的柑橘种质资源同时也拥有悠久的柑橘栽培历史。广西因其多样的地理类型、适宜的气候条件和优越的自然条件在长期的栽培种植演化中形成广西特有的柑橘种质资源,包括丰富多样的特有野生资源和地方栽培品种,已发展成为中国柑橘主产区。广西柑橘种质资源异常丰富,柑橘属各类品种均有涉及,如宽皮柑橘类、柚类、柠檬类、宜昌橙类、金柑属等。但近年由于各种检疫性病害和保护意识的缺失等原因广西柑橘资源的流失风险越来越大,因此广西地区柑橘资源的收集和保存工作越发紧迫重要。系统收集并保存广西野生及特有柑橘资源并利用SSR和SRAP分子标记方法研究其遗传多态性,明确广西野生及特有柑橘资源的现状和遗传亲缘关系,完善广西柑橘种质资源体系,为以后更好的利用现有柑橘资源应用于优良品种选育和产业生产等方面。本文通过SSR和SRAP两种分子标记方法对广西地区收集的34份材料包括广西野生、特有柑橘资源和参照材料进行遗传多态性分析,主要结果如下：1.对广西野生及特有柑橘资源进行收集,采用嫁接手段将材料保存于广西柑桔研究所资源圃。对34份实验材料叶片的叶型、嫩梢茸毛、嫩叶色泽、叶身形状、叶尖形状、叶基形状、翼叶、叶缘、叶形指数、翼叶叶形指数、叶柄长度进行观测统计。结果显示：枳壳与其他材料差异明显,为三出复叶,大翼橙类和柚类翼叶明显；剩余材料叶形态观测无明显差异。2.从48对SSR(simplesequencerepeat)引物进行筛选,得到22对扩增效果良好的引物对34份实验材料进行PCR扩增共产生220条多态性条带,平均每对引物10条多态性条带。采用UPGMA(unweightedpair-groupmethod,arithmetic)方法进行聚类,构建亲缘关系树图进行分析。SSR标记基本上能将宽皮柑橘、大翼橙类、柚类和柠檬类区分开来,但枳壳、酒饼勒、阳朔金柑与其他材料未能有效区分。3.从99对SRAP(sequence-relatedamplifiedpolymorphism)引物组合中选择11对扩增效果好的引物对34份实验材料进行遗传多态性研究,共获得215条清晰的多态性条带,平均每对引物扩增得到19.54条多态性条带。采用UPGMA方法进行聚类,构建亲缘关系树图进行分析,SRAP标记能将宽皮柑橘、大翼橙类、柚类等品种进行区分,显示柠檬类的广西土柠檬、黄黎檬与宽皮柑橘关系较近,而大翼橙类材料和柚类亲缘关系较近,但是阳朔金柑和酒饼勒2个属外种未能与其他品种有效区分。4.综合两种分子标记统计数据进行聚类分析获得结果与各个分子标记单独分析结果差异不大,均能将基本种类进行有效区分,SRAP较SSR更加真实反映34份材料间亲缘关系的远近。
【作者】刘通；
【导师】伊华林；
【作者基本信息】华中农业大学，果树学，2014，硕士
【关键词】广西柑橘；野生资源；特有资源；SSR；SRAP；遗传多态性；

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