重型脑外伤患者血液LncRNAs动态变化及差异表达

【摘要】背景：长链非编码RNA(LongnoncodingRNAs,lncRNAs)参与多种生物学过程,在保持正常细胞功能(如细胞增殖、凋亡、周期等)的同时在生物学过程中也发挥重要的调节作用。lncRNA的调节异常可导致多种神经系统疾病的发生如(),相关研究进展迅速；然而,lncRNA在创伤性脑损伤(traumaticbraininjury,TBI)发展过程中起到的作用仍不明确。本研究通过LncNRA表达谱探索TBI患者(血液)中存在的lncRNA对TBI的病理生理学机制是否发挥作用。方法：严格筛选格拉斯哥昏迷评分(GCS)小于8分的重型闭合性颅脑外伤患者,总共12个样本的血液组织,9例创伤性脑损伤成年男性患者(分别在24h、48h、72h共3个时间点采集静脉血)3例非创伤性成年男性对照组,提取总RNA,并进行单色基于微阵列基因芯片表达谱分析。进一步作包括基因本体(GO)分析和信号通路分析在内的生物信息学分析。结果：在每个观察时间点都有2倍以上差异表达,表达上调的lncRNA有232种,其中有生物学注释的较完整注释的lncRNA有75种；表达下调的lncRNA有63种,其中有生物学注释的较完整注释的lncRNA有22种。信号通路分析表明,lncRNA相关mRNA转录本对应有16种信号通路上调和10种信号通路下调(p<0.01)。GO功能分类分析表明,上调转录本对应的最高富集的GO靶标与补体和凝血级联反应相关,下调转录本对应的最高富集GO靶标与自然杀伤细胞介导的细胞毒作用相关。结论：1ncRNA在创伤性颅脑损伤研究领域目前尚未有报道,本课题率先探索了颅脑外伤后循环外周血血液中是否有lncRNA的参与,动态观察了其在伤后不同时间点上的变化趋势,发现了存在差异表达的lncRNA。其中参与上调的信号通路有16条,下调的信号通路有10条。随机选取其中两条通路进一步进行分子生物学功能注释Pathway分析,发现有自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、补体及凝血级联反应和细胞凋亡等一些与颅脑损伤过程密切相关的重要病理生理过程,有助于后续实验研究详细分析脑外伤后机体内继发应激反应的分子作用机制及颅脑创伤相关的诊断治疗策略。
【作者】李耀华；
【导师】张建宁；
【作者基本信息】天津医科大学，外科学，2014，博士
【关键词】创伤性脑损伤；基因芯片；长非编码RNA；表达谱；生物学标志物；

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