Notch信号通路中的Notch2、Hey2基因在单纯房间隔缺损、室间隔缺损中的突变研究

Notch信号通路中的Notch2、Hey2基因在单纯房间隔缺损、室间隔缺损中的突变研究

作者:师大云端图书馆 时间:2022-08-11 分类:参考文献 喜欢:1007
师大云端图书馆

【摘要】目的:本研究通过筛查Notch信号通路中Notch2、Hey2在先天性房间隔缺损(Atrialseptaldefect,ASD)及室间隔缺损(Ventricularseptaldefect,VSD)突变和单核氨酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNP),探讨基因Notch2、Hey2与先天性心脏病发病(CongentialHeartDisease,CHD)发病机制的相关性,为Notch信号通路在先天性心脏病发生学提供理论依据支持。方法:选择先天性房间隔缺损、室间隔缺损患者各50例和健康儿童100例,应用聚合酶链反应(Polymerasechainreaction,PCR)方法扩增Notch2基因的第7、8、32、33、34外显子和Hey2基因的所有5个外显子的序列,PCR产物纯化后经DNA测序仪直接测序,然后与NCBI数据库中Notch2、Hey2基因的序列进行比对,并与健康对照组比较,观察Notch2、Hey2基因突变情况;利用生物信息学方法预测Notch2、Hey2基因点突变对其蛋白结构和功能影响。结果:1.我们在Notch2基因的第7号、8号、33号外显子没有找到任何突变位点;在32号外显子发现4个新的杂合性突变位点:2个错义突变c.C5903T(p.Ala1968Val)、c.A5972T(p.His1976Leu)分别在1例ASD和1例VSD患者上发现,2个同义突变c.C5842T(p.Leu1948Leu)、c.C5925T(p.Asp1975Asp)分别在2例ASD和1例ASD患者上发现;在34号外显子中发现10例杂合性突变位点,4个错义突变:c.C6178T、c.A6343G、c.A7375G、c.C6313T,其中,c.C6178T和c.A6343G分别在3例ASD和1例VSD患者上发现,c.A7375G、c.C6313T则在健康儿童对照组中发现;6个同义突变:c.C6561T、c.A6435G、c.C6184T、c.C6159T、c.C6421T、c.T7341A,其中c.C6561T在2例ASD中发现,c.A6435G和c.C6184T各在1例VSD中发现,c.C6159T在1例健康对照组中发现,c.C6421T分布在6例ASD、4例VSD和7例健康对照组中,c.T7341A分布在4例ASD、3例VSD和7例健康对照组中。cDNA6421和cDNA7341的等位基因频率和基因型频率在实验组和对照组间分布的差异无统计学意义(P均>0.05)。2.采用了SIFT和PolyPhen两种生物信息学方法对Notch2基因的c.C5903T(p.Ala1968Val)、c.A5972T(p.His1976Leu)、c.C6178T(p.Arg2060Cys)、c.A6343G(p.Ser2115Gly)4个突变位点分析结果提示,c.C5903T与c.C6178T突变位点有可能影响蛋白功能,而c.A5972T与c.A6343G对蛋白质功能的影响是良性的。3.HEY2基因的所有外显子没有发现伴氨基酸改变的错义突变,仅找到了一个已报道的同义突变位点(rs=112235907),该位点的等位基因频率和基因型频率在实验组和对照组间分布的差异无统计学意义(P>0.05)。结论:1.Notch2基因可能是ASD患者相关的致病基因;2.Hey2基因可能不是ASD、VSD患者相关致病基因。
【作者】刘威;
【导师】吕海涛;
【作者基本信息】苏州大学,儿科学(专业学位),2014,硕士
【关键词】先天性心脏病;房间隔缺损;室间隔缺损;Notch信号通路;Notch2基因;Hey2基因;基因突变;单核氨酸多态性;

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