野蚕基因组研究Ⅰ

野蚕基因组研究Ⅰ

作者:师大云端图书馆 时间:2020-10-31 分类:参考文献 喜欢:3497
师大云端图书馆

【摘要】本学位论文的内容属于野蚕基因组研究的范畴,研究工作包括两个部分:1)柞蚕基因表达序列标签(EST)的研究,论文鉴定了EST中的SSR位点,并利用EST信息克隆了2个功能基因;2)乌桕大蚕蛾线粒体基因组的测定。论文对实验室获得的1500条柞蚕EST序列中的简单重复序列(SSR)进行了挖掘和鉴定。共鉴定了71个SSR位点,平均5.2kb出现一个位点。1-6个碱基的重复基元中,以3和4个核苷酸重复为主导类型。从合成的29对EST-SSR引物中,鉴定出8对具有多态性的引物,进一步的测序结果表明其中的4对为真实的SSR标记。开发的EST-SSR标记可用于柞蚕遗传与进化研究。论文从获得的柞蚕EST资源中,鉴定了柞蚕KK-42结合蛋白基因(KK-42BP)。蛋白序列的同源比较、功能域检测和进化分析均支持KK-42结合蛋白是一种新的微卵黄蛋白。但是,该基因在柞蚕的4个发育阶段、所检测的10种组织以及雌雄间均有表达。滞育期的表达模式说明,KK-42BP的减少与蛹的滞育相关。论文认为,KK-42BP基因除了具有卵黄蛋白的作用外,或许还具有另一种未知的功能。论文从柞蚕EST资源中,鉴定出了柞蚕真核细胞翻译起始因子4A基因(eIF-4A).eIF-4A基因在柞蚕的4个发育阶段和所有检测的组织都表达,说明该基因在柞蚕发育全过程起重要作用。同源比较表明,该基因在真核生物进化过程中高度保守。系统进化分析结果与经典分类学一致,表明该基因在真核生物的系统进化推断上具有潜在价值。论文还测定了乌桕大蚕蛾的线粒体基因组。该环状线粒体基因组长15282bp,包括13个蛋白编码基因(PCGs)、2个核糖体RNA基因(rRNAs)、22个转移RNA基因(tRNAs)和1个A+T富集区。该基因组的ATskew为正值,这和其它的大蚕蛾科的昆虫不同。基于线粒体基因组构建的系统进化树很好勾勒出了已被广泛认可的大蚕蛾科的进化框架。
【作者】谌苗苗;
【导师】刘彦群;王欢;李群;
【作者基本信息】沈阳农业大学,特种经济动物饲养,2014,硕士
【副题名】1.柞蚕基因序列表达标签的应用2.乌桕大蚕蛾线粒体基因组测定
【关键词】柞蚕;乌桕大蚕蛾;EST-SSR;真核转录起始因子4A;KK-42结合蛋白基因;线粒体基因组;

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