CTCF对体细胞重编程的调控作用及其初步机制研究

【摘要】CCCTC结合因子(CTCF)是一个高度保守的蛋白，在生物体内广泛的表达，它包含有11个非常保守的锌指结构域。CTCF作为基因组的组织者，参与许多的生物学功能，包括基因的转录激活或者抑制，基因印记，染色质绝缘，X染色体失活，染色质高级结构调控等。已经报道CTCF在胚胎干细胞中介导功能性染色质间的相互作用，然而关于CTCF在重编程中的作用知之甚少。本课题对CTCF在体细胞重编程的调控作用进行了研究，我们发现CTCF在重编程的过程中必须得到严格的控制，在MEF或者pre-iPS细胞中过表达CTCF或者通过shRNA以及siRNA抑制CTCF的表达均抑制克隆的有效形成。我们发现单独的N末端或者单独的C末端不能起到有效的抑制作用。CTCF能够发生ADP核糖基化，3’-ABA通过抑制ADP核糖基化明显抑制重编程，即便是在重编程的后期仍能明显抑制重编程。为了进一步挖掘CTCF如何调控重编程过程，我们做了重编程三个阶段不同细胞（MEFs，pre-iPSCs和iPSCs）的CTCF的ChIP-seq。通过生物信息分析，我们发现CTCF的结合位点在三种细胞中高度保守，三种细胞的CTCF结合模体一样，然而CTCF的结合位点在三种细胞中存在明显的差别。在pre-iPS细胞中，CTCF与RNA聚合酶II共定位并参与RNA聚合酶II依赖的转录调控。此项研究有助于我们更全面地了解和丰富CTCF在哺乳动物基因组的功能。
【作者】黄开猛；
【导师】金景姬；姚红杰；
【作者基本信息】吉林大学，生物化学与分子生物学，2014，硕士
【关键词】CTCF；体细胞重编程；3’-ABA；RNA聚合酶II；

【参考文献】
[1]陈新宇.论贾谊对司马迁及《史记》的影响[D].东北师范大学,中国古代文学,2012,硕士.
[2]李宝玲.基于ITIL的SOC平台的研究与实现[D].曲阜师范大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[3]尚国伟.基于再分析资料中欧亚大陆土壤湿度的变率及其与北半球大气环流相互作用的研究[D].南京大学,气象学,2013,硕士.
[4]陈勇.油酸对肺损伤体外模型SP-B表达的初步研究[D].遵义医学院,呼吸内科（专业学位）,2014,硕士.
[5]陈健.超声雾化热解法制备ZnO薄膜结构及其性能研究[D].北京工业大学,材料学,2004,硕士.
[6]吴海云.上海Stulz公司并购案例分析[D].兰州大学,工商管理（专业学位）,2013,硕士.
[7]王.主体教育视域下学生参与教学的有效性与提升策略研究[D].渤海大学,课程与教学论,2014,硕士.
[8]赵瑞霖.自动静态图像前景提取[D].吉林大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[9]谭小土.城市轨道交通快慢车运行组织研究[D].西南交通大学,交通运输规划与管理,2014,硕士.
[10]殷维真.中高级阶段韩国留学生口语语篇衔接研究[D].南京师范大学,对外汉语教学,2012,硕士.
[11]张文生,何樵登.利用VSP和跨孔走时反演横向各向同性介质中的弹性常数[J].石油地球物理勘探,1997,03:345-356+462.
[12]郭兆曾.步进电机锁相控制系统的分析和设计[J].自动化学报,1982,04:249-256.
[13]綦琪.论我国个人收入分配体系的完善[D].东北大学,马克思主义中国化研究,2009,硕士.
[14]毛严奇.社交云平台下用户行为分析的研究[D].湖南师范大学,计算机软件与理论,2013,硕士.
[15]吴艳.玫瑰醚的合成工艺研究及香茅醇的拆分[D].天津大学,化学,2013,硕士.
[16]畅艳娜.黄芪多糖对辐射致乳鼠心肌细胞损伤的保护作用及其机制探讨[D].甘肃中医学院,中西医结合临床,2014,硕士.
[17]徐百龙,夏银锋,王向前,王俏丽,刘楠,李伟.硅油对生物滴滤塔处理邻二甲苯废气的影响[J].高校化学工程学报,2014,05:1154-1159.
[18]董钰婧.日本医疗剧同声传译实践报告[D].河北大学,日语口译,2014,硕士.
[19]李艳.小学升初中择校问题研究[D].东北师范大学,教育经济与管理,2012,硕士.
[20]刘珍杰.气泡法合成银纳米颗粒[D].华东师范大学,物理化学,2013,硕士.
[21]郭晗.当归多糖对人牙髓细胞增殖和成骨方向诱导分化的影响[D].河北医科大学,口腔医学（专业学位）,2014,硕士.
[22]许君.完善高校校规提高大学生思想政治教育有效性[D].温州大学,思想政治教育,2012,硕士.
[23]程清.《功夫熊猫2》中熊猫形象的重塑与融合[D].湖北工业大学,外国语言学及应用语言学,2014,硕士.
[24]丁华.鼻咽癌患者外周血单核细胞中GSH含量测定及其临床意义[D].广西医科大学,肿瘤学,2004,硕士.
[25]屈文会.城市化进程中南京农民工与城市体育融合的现状与对策研究[D].南京师范大学,体育教育训练学,2012,硕士.
[26]娄菲.全健排舞在济南市大众健身中的开展现状与推广策略研究[D].山东师范大学,体育教育训练学,2013,硕士.
[27]张羽.微网逆变器并网/孤岛及切换控制方法研究[D].哈尔滨工业大学,控制科学与工程,2013,硕士.
[28]景钰洲.掺杂A1_xGa_(1-x)N半导体光、电性能的理论研究[D].西北大学,微电子学与固体电子学,2013,硕士.
[29]田罗银.全国劳模及历史作用研究（1950-1980）[D].上海交通大学,马克思主义理论,2013,硕士.
[30]刘竞超.CO_2膜吸收—膜解吸耦合操作过程的行为研究[D].北京化工大学,化学工程与技术,2013,硕士.
[31]李晓龙.高速列车齿轮驱动装置建模及其动态特性研究[D].西南交通大学,交通运输工程,2013,硕士.
[32]王铁.甲状腺术中喉返神经监测技术肌电图基本参数的解读和应用[D].吉林大学,临床医学,2013,硕士.
[33]陈凯.南京邮电工程公司发展战略研究[D].华中科技大学,工商管理,2013,硕士.
[34]宋晖.在线数字商品流通问题研究[D].华中师范大学,产业经济学,2013,硕士.
[35]寇建群.中华眼镜蛇蛇毒免疫调节作用及机制探讨[D].苏州大学,药理学,2014,硕士.
[36]程桦.敏捷供需链中的物流管理研究[D].浙江大学,控制理论与控制工程,2004,硕士.
[37]郭雨春.“首秦板坯连铸机过程控制系统研制与开发”通过验收[J].冶金自动化,2013,04:11.
[38]乔小改.Survivin基因rs9904341和rs1042489位点多态性与子痫前期的相关性研究[D].郑州大学,妇产科学,2013,硕士.
[39]宋娜娜.具有阶段结构的酗酒模型的全局稳定性[D].兰州理工大学,应用数学,2013,硕士.
[40]杨树凯.全身韧带松弛对关节镜下外侧松解内侧紧缩术治疗青少年复发性髌骨脱位的响影[D].泰山医学院,运动医学,2012,硕士.
[41]柴玉璞.根据重力异常计算基岩深度的方法[J].石油地球物理勘探,1981,01:55-63.
[42]姚毅.合作学习在高中作文教学中的应用[D].信阳师范学院,学科教学,2014,硕士.
[43]温美枝.高中数学建模研究[D].内蒙古师范大学,教育（专业学位）,2013,硕士.
[44]欧阳华.基于供应链采购的二十二冶海外事业部供应商管理研究[D].燕山大学,物流工程,2012,硕士.
[45]漆晓勤.《四库全书》经部文献中的伏羲史料考辨[D].西北师范大学,中国古典文献学,2014,硕士.
[46]张成成.传统作韵技法在当代筝曲中的继承发展[D].天津音乐学院,音乐表演,2013,硕士.
[47]本报记者蔡炜.常州：找准创新接口引领新常态[N].新华日报,2015-05-15001.
[48]冯棣.咸水造墒条件下棉花耐盐指标与安全性评价[D].中国农业科学院,农业水土工程,2014,博士.
[49]张奕.n-3、n-6多不饱和脂肪酸对3T3-L1脂肪细胞脂联素表达的影响及PPARγ介导的机制[D].南方医科大学,营养与食品卫生学,2012,硕士.
[50]屠吉利.巾类织物擦拭吸水性能测试方法的建立及评价体系的研究与应用[D].浙江理工大学,纺织化学与染整工程,2013,硕士.