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基于方差和中值调整的RNA-Seq数据标准化方法及其评估 11月22日

【摘要】随着新一代高通量测序技术的飞快发展,RNA测序技术(RNA-Seq)已经被广泛应用于各种生物的转录组分析中。由于不同的测序文库是由不同测序泳道产生的且测序深度有所不同,导致不同文库不能直接进行比较分析。因此,需要对测序文库序列数据进行标准化处理来调整不同测序泳道的总序列数,消除实验过程中测序技术上的误差,使能够更准确地分析基因的表达差异。本文提出了最小方差中值标准化方法,基于方差和中值调整 […]

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黑龙江立克次体基因组与感染小鼠转录组研究 06月18日

【摘要】黑龙江立克次体是我国学者首次分离的新立克次体病原体,属于立克次体属斑点热群立克次体,是远东斑点热的病原体。为了获得黑龙江立克次体全基因组序列,本研究进行了黑龙江立克次体的全基因组测序并进行了比较基因组和泛基因组研究。通过基因组分析发现,黑龙江立克次体基因组是一个全长1,278,471bp的环状基因组,没有质粒,基因组G+C含量为32.32%,有1,333个基因,其中编码蛋白质的基因1,29 […]