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蛋白质—肽段全柔性对接的并行计算研究 06月30日

【摘要】蛋白质-肽段复合物相关的结构信息对于新药的研制和设计有非常重要的作用。蛋白质和肽段的计算对接方法可以为用实验方法探究蛋白质-肽段交互作用做补充。现实世界中,蛋白质-肽段对接过程包含三个并行的过程:从头折叠肽段,肽段与受体的对接和靠近肽段的一些受体柔性区域的优化。一些现有的计算方法已经被用在这几个过程中自由度的采样,但这些方法通常都是以顺序的机制触发运行。蛋白质-肽段对接时受体的骨架柔性问题 […]