【摘要】随着基因组学和蛋白组学的出现，生物序列的图形表示发展到定量的数值特征，目前已经成为生物信息学的一个重要研究课题。论文给出DNA和蛋白质序列的可视化谱型图表示、数学描述模型，并在相似性分析和进化树的构造等方面进行了研究。(1)依据核苷酸的分类，给出了一种DNA序列的谱型图表示，能反映核苷酸序列的功能和结构信息。然后计算谱型图振幅的频率作为描述子，并给出计算描述子的理论值的数学表达式，运用这些 […]

【摘要】随着测序技术的迅猛发展，生物序列的数量在数据库中呈指数形式增长。对于海量的生物数据，如何进行信息提取、比较分析、关系挖掘，已成为当代分子生物学和生物信息学的一个重要任务。直接从杂乱无章的生物序列本身提取信息、发现其隐藏的规律，已经相对比较困难。生物数据的可视化研究为人们处理海量的生物数据提供了一种新的途径。如何有效利用生物序列的图形表示形式对序列进行分类及生物进化关系的分析，是生物信息学的 […]

【摘要】近年来，基因组计划的实施，使得DNA序列数据激增，对产生的海量序列进行有效地分析成为生物信息学的首要任务之一．其中，基因非编码区的解读已经成为科学家面临的挑战，对模体的研究是此领域一个重要的问题，因为识别模体是理解基因转录机制和表达模式的关键．对于此领域大量的DNA数据，将贝叶斯统计方法中的先验信息和后验分布的思想引入到序列分析当中，成为国内外学者讨论的热点问题．本论文采用贝叶斯统计方法对 […]

【摘要】复杂网络的广泛研究源于其在建模真实数据结构时表现出的灵活性和普适性。一个复杂网络可以展示出刻画系统中个体的连接关系以及影响系统动态功能行使的结构特性。关于复杂网络结构特性度量方面的研究工作涉及到：将一个目标系统表示成网络结构；通过一系列富含系统结构信息的度量指标，分析网络拓扑结构属性；量化演化网络的结构属性值的变化，说明系统动态演化过程中网络的连接关系是如何变化的；使用拓扑结构度量指标来挖 […]