酿酒酵母转录延伸因子Paf1复合物亚基Rtf1中HMD及Plus3结构域及布氏锥虫未知功能蛋白PDZ结构域结构的初步研究

【摘要】蛋白质是生命体的重要组成成分,是生命活动最主要的实施者。蛋白质的功能大多通过与配体如生物大分子的相互作用实现,某些结构域在其中扮演关键角色。研究这些结构域的结构对于阐明其作用机制及进一步揭示全蛋白的功能机制是必不可少的。在本课题中,我们选取了几个参与重要蛋白与配体相互作用的结构域,即酿酒酵母的Rtfl-Plus3、Rtfl-HMD及布氏锥虫中一个未知功能蛋白的PDZ结构域,对其结构进行了初步研究,以期解析高分辨结构,为揭示其作用机制和在全蛋白功能中扮演的角色打下基础。(Ⅰ)Rtfl是转录延伸因子PaflC中的重要组成部分,通过自身的几个独立的功能结构域经由不同的途径影响转录过程。目前Rtfl的具体功能机制尚不明确。本课题中我们重组克隆、表达和纯化了酿酒酵母Rtfl的两个主要参与配体相互作用的结构域Plus3和HMD,并用圆二色谱(CD)和核磁共振(NMR)等对其结构进行了初步研究。我们已基本确定了异源重组制备该两个结构域并对其进行多维NMR研究的合适的实验条件,为进一步解析其三维结构和揭示其功能机制打下了基础。(Ⅱ)PDZ结构域是介导蛋白与蛋白相互作用的重要结构域之一,能够识别靶蛋白C-末端的序列。PDZ结构域能够参与多样性的生物过程如：胞内运输、离子通道以及信号转导等。利用生物信息学的方法,我们在布氏锥虫基因组数据库中发现几个含PDZ结构域的蛋白。在本课题中,我们重组克隆、表达和纯化了这几个PDZ结构域,并对其中一个通过NMR方法对其进行了初步结构研究,以期为进一步认识其功能机制作出贡献。该’PDZ结构域的主链和部分侧链化学位移的认证已完成,CSI二级结构分析显示其由8个p折叠片和一个a螺旋组成,与经典的PDZ结构域的结构组成有一定的差异。布氏锥虫属于低等的真核生物,其PDZ结构域结构的解析,一方面可对其相关生命活动机制的阐明打下基础,另一方面可为揭示PDZ结构域的进化提供线索。
【作者】董元秋；
【导师】张学成；
【作者基本信息】安徽大学，生化与分子，2014，硕士
【关键词】酿酒酵母；Paf1复合物；Rtf1；Plus3结构域；HMD结构域；布氏锥虫；PDZ结构域；核磁共振；

【参考文献】
[1]张冬梅,俞立.线性时滞系统稳定性分析综述[J].控制与决策,2008,08:841-849.
[2]王盼盼.企业人力资本对内部控制有效性影响的研究[D].兰州理工大学,会计学,2012,硕士.
[3]马倬.靶向C-myc逆转厄洛替尼耐药性的作用[D].南京医科大学,药理学,2013,硕士.
[4]何松.基于FPGA的罗兰C路基导航系统RS编译码器的设计与实现[D].西南交通大学,电子与通信工程,2014,硕士.
[5]邢国玺.圆锥滚子轴承织构化内圈大挡边油膜润滑特性分析[D].河南科技大学,机械设计及理论,2014,硕士.
[6]张亚婕.延迟采收对烟叶显微和亚显微结构的影响研究[D].云南农业大学,植物学,2014,硕士.
[7]史双双.泸州烤烟品质区划及其物质基础分析[D].河南农业大学,烟草学,2012,硕士.
[8]王长亮.HCY集团财务管控体系研究[D].山东大学,工商管理（专业学位）,2012,硕士.
[9]柳志艳.心理障碍青少年问题的社会工作实务研究[D].苏州大学,社会工作（专业学位）,2013,硕士.
[10]刘洪涛.沈阳理工大学应用技术学院图书馆管理系统[D].电子科技大学,软件工程（专业学位）,2012,硕士.
[11]李焕平.三黄烧伤灵对金黄色葡萄球菌生物膜影响的实验研究[D].内蒙古大学,生物工程,2014,硕士.
[12]郑仲润.华南湿热地区纤维沥青碎石封层适应性研究[D].长安大学,道路与铁道工程,2013,硕士.
[13]胡鑫亮.自然垄断行业的政府有效管制研究[D].湖北大学,行政管理,2011,硕士.
[14]陈超祥.基于数据仓库的综合决策支持系统(SDSS)模型及其应用[J].电脑知识与技术,2005,21:8-10.
[15].行业动态[J].城市环境设计,2014,01:229+237-241.
[16]张睿刚.超高膨胀比涡轮机气动性能研究[D].哈尔滨工业大学,动力工程,2014,硕士.
[17]王凤阁.基于利益相关者角度的国美公司法人治理研究[D].兰州大学,会计（专业学位）,2013,硕士.
[18]张波.生物油对尿素SNCR过程影响的实验研究[D].华中科技大学,热能工程,2013,硕士.
[19]屈乾沁.云制造模式下汽车制造企业制造资源组合配置研究[D].北京交通大学,2013.
[20]彭金宁.供电系统用户供电可靠性研究[D].西安理工大学,水利水电工程,2004,硕士.
[21]秦岭.慢病毒载体介导小鼠卵巢颗粒细胞内特异性超表达VEGF基因的研究[D].南京农业大学,动物遗传育种与繁殖,2012,硕士.
[22]沈卿.论醉酒驾驶犯罪的若干问题[D].华东政法大学,法律（专业学位）,2012,硕士.
[23]叶林.数字化困境：版权保护的技术措施[D].清华大学,法律,2003,硕士.
[24]沈丽.林地流转下的村庄治理[D].华中师范大学,政治学理论,2012,硕士.
[25]万辰.积分促销对品牌资产的影响研究[D].江西财经大学,企业管理,2013,硕士.
[26]吴晶晶.水稻抽穗期延迟突变体ah(t)的遗传分析及基因的精细定位[D].南京农业大学,作物学,2013,硕士.
[27]鲁刚,张宏莉,叶麟.P2P流量识别[J].软件学报,2011,06:1281-1298.
[28]夏祥林.我国农村房屋流转法律问题研究[D].苏州大学,法律,2012,硕士.
[29]苑亦男.石墨烯/氢氧化镍复合电极材料的制备及其超级电容器性能研究[D].哈尔滨工业大学,2014.
[30]李爽.基于“效率抵消总量”的用水效率理论及钢铁行业的实证研究[D].华东师范大学,环境科学,2013,硕士.
[31]刘方.托克逊彩花沟矿区Ⅲ号矿外围矿体定位预测方法研究[D].新疆大学,地球探测与信息技术,2013,硕士.
[32]刘春林.黑龙江省农村税费改革政策研究[D].东北农业大学,种植业,2003,硕士.
[33]冯宇哲.三电平有源滤波器调制与控制策略研究[D].哈尔滨工业大学,电气工程,2014,硕士.
[34]马涛.利用奥运经济发展天津主要非货物贸易行业的研究[D].天津工业大学,企业管理,2004,硕士.
[35]高宁.流程工业CIMS中知识管理的应用研究[D].清华大学,控制理论与控制工程,2003,硕士.
[36]邱晓莹.论我国法官错案责任追究机制的建立[D].安徽大学,法律,2014,硕士.
[37]杨宝森.民事再审程序的功能[D].中国政法大学,法律,2003,硕士.
[38]朱攀蓉.飞行数据综合记录分析技术研究[D].西北工业大学,2005.
[39]冯秋明,潘键.多金属硫化矿床高效开采和综合利用的范例[J].有色金属.1993(01)
[40]马丽丽.巯基化合物修饰CdX量子点的合成及其荧光性质[D].河北师范大学,无机化学,2012,硕士.
[41]赵建飞.寒区村镇净水构筑物增温系统设计及运行模拟[D].哈尔滨工业大学,供热、供燃气、通风及空调工程,2013,硕士.
[42]赵毛毛.鼓式制动器接触分析与仿真[D].长安大学,机械电子工程,2013,硕士.
[43]刘畅.CSC2000平台下变电站自动化系统应用[D].东北石油大学,控制工程（专业学位）,2013,硕士.
[44]朱艺媛.变性椭圆齿轮行星轮系宽窄行分插机构机理分析与优化[D].浙江理工大学,机械设计及理论,2013,硕士.
[45]吴继霞,冷洁.对不同类型传主的人格特征研究——基于心理传记学方法的应用[J].心理科学,2014,04:783-789.
[46]贾玲.玉米芯木质纤维素组分分离研究[D].天津大学,化学,2013,硕士.
[47]李善山.多元一体——美国建国初期宪法研究[D].华东师范大学,世界史,2004,硕士.
[48]邵平,王钧,王星丽,瞿亮,孙培龙.近红外漫反射光谱技术快速无损识别灵芝和云芝提取物研究[J].核农学报,2015,03:499-505.
[49]申昱.基于FPGA的FFT算法设计与研究[D].西安电子科技大学,计算机应用技术,2011,硕士.
[50]沙京祺.认知OFDM协作系统资源分配算法研究[D].吉林大学,信号与信息处理,2014,硕士.