翘嘴鳜Leptin-b基因结构、进化及表达分析

【摘要】从本实验室的翘嘴鳜(sinipercachuatsi)转录组数据库中搜索得到Leptin-b基因部分cDNA序列,首先通过NCBI数据库比对初步确定序列的准确性,然后通过PCR、测序获得最终准确的Leptin-b部分核心cDNA序列。根据该序列,分别设计5’和3’RACE引物进行RACE扩增,得到Leptin-b基因5’和3’末端序列,拼接得到Leptin-b的cDNA序列。应用GenomeWalker方法获得Leptin-b5’侧翼区序列,然后克隆得到Leptin-b基因内含子序列,拼接得到嘴鳜翘Leptin-b基因组DNA序列。Leptin-b基因的cDNA序列全长为698bp,包括471bp的开放读码框,编码157aa的蛋白质,5’-untranslatedregion(UTR)长度为130bp,3’-UTR长度为94bp；推导的aa序列含有20个aa残基的信号肽,两个半胱氨酸残基以便用于二硫键的形成。Leptin-b基因5’侧翼区长度为418bp,上游30bp处发现典型的TATAbox,此外还存在其他调控元件：CREB(155bp)、AP2(209bp)、AP1(242bp).GATA(286bp).C/EBP(305bp和325bp)。基因结构对比分析表明,翘嘴鳜Leptins(Leptin-a和Leptin_b)基因只含有一个内含子,通过与其他物种Leptin基因结构的比较发现,翘嘴鳜Leptins基因的内含子在基因内所处的位置与其他物种Leptin基因中内含子2所处的位置基本一致,表明在翘嘴鳜进化过程中,Leptins基因很可能丢失了内含子1。蛋白质三级结构预测表明,其蛋白质三维结构与人Lentin蛋白非常保守,两个半胱氨酸残基以便用于二硫键的形成,都具有四个螺旋和中间一段连接肽的结构特征。系统进化树结果表明,虽然在鱼类Leptin簇中也存在多分枝,但哺乳动物Leptin明显同鲤科鱼类Leptin-b聚集成簇,所以鲤科鱼类Leptin_b很可能同哺乳类Leptin是直系同源的,同时,需要更多鱼类物种Letin-b的序列信息来验证。检测翘嘴鳜和草鱼(Ctenopharyngodonidellus)Leptins(Leptin-a和Leptin-b)及其受体(Lepr)基因在各组织中的表达水平,比较肉食性鱼类和草食性鱼类中Leptins的表达模式。翘嘴鳜Leptin-a的主要表达部位是肝脏,在其他组织中只有少量表达；但在草鱼中,Leptin-a在肝脏及脑各组织中的表达量均较高。在翘嘴鳜中,Leptin-b在脑的各个组织中的表达水平均比较高；然而在草鱼中,除了小脑外,其他的脑组织Leptin-b的表达水平都很低。不管是在草鱼还是翘嘴鳜中,Lepr在检测各组织中均有表达。Leptins在翘嘴鳜和草鱼中不同的表达模式说明,在肉食性和草食性鱼类中,不同亚型Leptin的功能可能存在差异。
【作者】黄威；
【导师】谭青松；梁旭方；
【作者基本信息】华中农业大学，水产养殖，2014，硕士
【关键词】翘嘴鳜；瘦素；基因结构；进化；组织表达；草鱼；

【参考文献】
[1]赵建会.评分方法、评分标准制定者和学生样本对作文分数的影响[D].山西大学,外国语言学及应用语言学,2004,硕士.
[2]李璐一.基于Kinect的物体分割与识别算法研究[D].重庆大学,仪器科学与技术,2014,硕士.
[3]王建利.滚动轴承性能退化评价与趋势预测研究[D].大连理工大学,机械制造及自动化,2013,硕士.
[4]邓萍萍.湖北文化创意产业竞争力提升对策研究[D].中共湖北省委党校,政治经济学,2014,硕士.
[5]黄国民.论我国隐名股东权利保护制度[D].厦门大学,法律,2014,硕士.
[6]赵旭庭.半番鸭生产性能的研究与推广[D].中国农业大学,农业,2004,硕士.
[7]陈少飞.Web信息抽取规则的优化及规则的XQuery表达[D].河北大学,计算机应用技术,2003,硕士.
[8]吴珊珊.二胡套曲《袍修罗兰—如来梦》美学内涵与艺术价值探究[D].西安音乐学院,二胡演奏,2014,硕士.
[9]王旭.对发展性历史教师评价的研究[D].东北师范大学,教育,2003,硕士.
[10]王瑶.新课改下高中学生历史意识的培养[D].东北师范大学,教育,2012,硕士.
[11]陈晓文.论知识产权的海关保护[D].对外经济贸易大学,法律,2004,硕士.
[12]吕海龙.液晶聚硅氧烷类成核剂诱导PP结晶结构与形态的研究[D].东北大学,高分子化学与物理,2010,硕士.
[13]蔡龙平.基于物联网技术的配送车辆管理系统方案规划[D].郑州大学,物流工程（专业学位）,2013,硕士.
[14]刘才德.论我国保险中介市场的培育和发展[D].西南财经大学,工商管理,2003,硕士.
[15]林婷婷.云南省边疆民族地区县级财政困境及解困对策[D].云南财经大学,财政学,2014,硕士.
[16]杨幼丽.模因论视角下的博物馆文物翻译研究[D].宁波大学,英语语言文学,2014,硕士.
[17]李倩.月见草油三种不同提取方法的比较及微胶囊化研究[D].吉林农业大学,食品科学,2012,硕士.
[18]陆军,王建朝,赵美峰,黄严.氧化石墨烯的制备及电化学性质研究[J].材料导报,2014,22:28-31.
[19]汪卫.SBBR法降解选矿废水中苯胺黑药的共代谢研究[D].广东工业大学,环境工程科学与工程,2014,硕士.
[20]贺芳.经济类英语学术论文引言研究—从宏观分析到微观分析[D].重庆大学,外国语言学及应用语言学,2014,硕士.
[21]任书荣.CD59基因突变与蛋白质糖基化相关性的研究[D].青岛大学,病原生物学,2004,硕士.
[22]杨智刚.3D组态技术在舞台车台控制系统中的研究与应用[D].兰州理工大学,控制理论与控制工程,2014,硕士.
[23]窦晓雪.价值创造导向的上市商业银行内部控制框架研究[D].东北农业大学,会计学,2013,硕士.
[24]沈鑫.我国民事诉讼无独立请求权第三人制度重构研究[D].内蒙古大学,诉讼法学,2013,硕士.
[25]李朝阳.亚太软交换建设趋势分析[J].现代电信科技.2006(08)
[26]姜叶飞.惩罚变量选择方法比较分析及其在信用卡信用风险中的应用[D].厦门大学,统计学,2014,硕士.
[27]周静静.90后大学生人格特质和创业意向的关系研究[D].中国科学技术大学,工商管理,2014,硕士.
[28]杨雨薇.受损钢框架结构受力性能研究[D].中南林业科技大学,结构工程,2014,硕士.
[29]王赫然.大径厚比KDP晶体低应力夹持组件力学特性研究[D].哈尔滨工业大学,机械工程,2014,硕士.
[30]王永忠,梁彦,赵春晖,潘泉.基于多特征自适应融合的核跟踪方法[J].自动化学报,2008,04:393-399.
[31]罗苏川.弱声练唱对于声乐学习的重要性研究[D].西南交通大学,音乐与舞蹈学,2014,硕士.
[32]奚小艳.用于CO完全氧化的负载型催化剂改性的对比研究[D].北京化工大学,化学工程与技术,2013,硕士.
[33]辜贵如.斯堪纳机械制造有限公司物流管理研究[D].西南交通大学,物流工程,2013,硕士.
[34]廖福涛.从功能视角评析小说《围城》中语码转换的人际意义[D].江西师范大学,英语语言文学,2004,硕士.
[35]王栋.基于PCI总线的高速数据传输系统的研制[D].中北大学,测试计量技术及仪器,2013,硕士.
[36]张启舜,沈振荣.我国节水型灌溉农业发展的前景和问题[J].科技导报.1991(06)
[37]岳洋洋.污水处理系统中氨氧化古细菌富集筛选及氨氧化特性研究[D].哈尔滨工业大学,环境科学与工程,2013,硕士.
[38]周东明.bFGF-PRP胶原支架复合物修复骨缺损的实验研究[D].内蒙古科技大学包头医学院,临床医学,2013,硕士.
[39]苏芸.新型卤氧化铋复合可见光催化剂的制备及光催化性能研究[D].上海大学,2013.
[40]田畅.DR公司面向招聘的素质模型建立及应用[D].东北大学,工商管理,2010,硕士.
[41]夏则爱.轨道交通大型换乘节点建设与城市地下空间的综合开发[J].城市轨道交通研究.2005(05)
[42]张瑞菊.空间数据挖掘方法及其与GIS集成模式的应用研究[D].山东科技大学,2003.
[43]刘宇奇,陆一平,查建中,贾凌燕.矩形块划分的二维空间数据挖掘算法及其应用[J].北京交通大学学报,2005,04:107-110.
[44]何长元.北京市园林绿地的演变机制及格局研究——以海淀区为例[D].中国农业大学,土地资源管理,2004,硕士.
[45]张俊芳.高校校园网升级改造方案的设计与实现[D].华南理工大学,计算机技术,2014,硕士.
[46]沈伟锋.面向攻击的网络漏洞扫描技术研究及系统实现[D].西北工业大学,计算机软件与理论,2004,硕士.
[47]吴星儒.《发展汉语—高级阅读》与《博雅汉语—高级飞翔篇》阅读练习题的比较研究[D].吉林大学,汉语国际教育,2013,硕士.
[48]彭建刚刘明周张玺张铭鑫葛茂根.基于Pareto优化的离散自由搜索算法求解多目标柔性作业车间调度问题[J].中国机械工程,2015,05:.
[49]卢亚平.基于分子线修饰碳糊电极的电化学传感器的研究与应用[D].青岛科技大学,2013.
[50]李秀满.考虑延时模型的任务映射与调度算法研究[D].哈尔滨工业大学,微电子学与固体电子学,2013,硕士.