家鸡SSR和MHC位点的进化关系及群体遗传结构分析

家鸡SSR和MHC位点的进化关系及群体遗传结构分析

作者:师大云端图书馆 时间:2015-10-30 分类:参考文献 喜欢:3944
师大云端图书馆

【摘要】DNA分子多态性为鉴定物种的遗传多样性和群体结构提供了重要信息。在研究各种家养动物的群体内遗传多样性和群体间遗传关系和结构中,微卫星DNA标记(SSR)是应用最为广泛的遗传标记之一。迄今为止,有许多研究应用这些中性基因座对来自全世界各大洲和不同生产、管理及历史背景的家鸡群体遗传多样性和群体遗传结构进行了评估和分析,发现群体遗传结构与它们的地理分布基本一致,而遗传多样性水平则与其管理背景相关。鸡主要组织相容性复合物(MHC)位于鸡16号染色体上,是基因组中最高变异区域。MHC区域编码的基因在免疫系统内起到主要作用,许多MHC基因编码的蛋白参与抗原与T细胞呈递过程。所以研究MHC区域的多样性有助于理解病原与宿主间的相互作用。目前,尽管MHC区域的受选择的性质还不清楚,但已有三种假设,如杂合优势、稀有等位基因优势和波动选择,用于解释MHC的高度遗传多样性。本研究旨在比较MHC区域多态性和常染色体微卫星体系所代表的基因组水平遗传多样性和群体结构的异同,探索MHC的进化机制,评价MHC区域的遗传多样性是否适用于研究群体的遗传关系。本研究通过对来自不同大洲、不同背景及培育历史的25个家鸡和野生原鸡群体进行研究,主要结果如下:1.采用7个MHC微卫星基因座对500份家鸡和原鸡样品进行遗传多样性分析,在25个群体中共发现了94个等位基因,其中在基因座LEI0258、GAB0001和MHC0371上检测到的等位基因数最多,分别为43、12和12个;除了MCW0312、MHC-D和MHC-T的多态信息含量(PIC)较低外,其他各基因座的PIC均大于0.5,呈现较高的多态性;MHC基因座的期望杂合度与群体间的FST呈显著的负相关(R2=-0.9629)。2.将MHC区域单个基因座和单倍型水平上的NA、HO和HE与29个常染色体微卫星基因座所代表的基因组水平上的遗传多样性进行比较,发现大多数群体MHC区域的遗传多样性要明显高于基因组水平;但是也有个别特殊群体相反,例如按血系B15进行定向培育的实验品系R22。3.通过估测群体间的遗传分化,表明各大洲地方群体间在MHC区域所表现的变异要小于29个基因座所代表基因组水平上的变异;基因组水平与MHC区域的FST之间无相关性(MHClocus-wisevs29SSR,R2=0.4128;MHChaplotypevs29SSR,R2=0.3145)。4.在群体遗传结构分析中,25个群体在基因组水平上的变异遵循着地理来源和管理历史的差异;而MHC区域的变异则没有体现出上述特征。5.为了验证以上试验结果,本研究又开展了相关验证试验,即采用大样本量、大地理距离和管理背景差距的5个群体,深入分析MHC的群体结构特征,进一步印证了上述结果。
【作者】俄广鑫;
【导师】韩建林;
【作者基本信息】中国农业科学院,动物遗传育种与繁殖,2014,博士
【关键词】主要组织相容性复合体;遗传多样性;微卫星标记;单倍型;群体遗传结构;

【参考文献】
[1]胡立生,邵惠鹤,孙优贤.非线性系统的鲁棒采样控制[J].自动化学报,2000,06:835-839.
[2]刘诗晨.谱系学视域下的当代审美景观[D].上海师范大学,文艺学,2013,硕士.
[3]卢玮.腹腔镜下观察子宫内膜异位症对输卵管功能的影响[D].吉林大学,临床医学,2013,硕士.
[4]张少华.含有噻唑核心结构的AKT变构抑制剂的合成[D].华东理工大学,制药工程,2013,硕士.
[5]姜南.新疆少数民族地区重大公共危机治理研究[D].长安大学,公共管理(专业学位),2013,硕士.
[6]兰馗博.碳纳米管小孔径互连以及相关工艺的研究[D].天津理工大学,2014.
[7]赵靖.0.003Hz~10kHz感应式磁传感器的设计与实现[D].吉林大学,电路与系统,2013,硕士.
[8]屈磊.三维重构理论与算法研究[D].安徽大学,电路与系统,2004,硕士.
[9]夏颖.移动互联网用户价值的评价与分析方法[D].首都经济贸易大学,管理科学与工程,2014,硕士.
[10]丁大明.网络安全技术研究及其在工程中的应用[D].福州大学,信息与通信工程,2003,硕士.
[11]李永鹏.基于单片机的远程智能电表抄表系统设计[D].大连理工大学,控制工程(专业学位),2012,硕士.
[12]邢淑慧.企业成长性价值评估体系构建与实证研究[D].天津商业大学,会计学,2013,硕士.
[13]苏昭斌.基于粒子群与混沌学的海杂波抑制方法[D].江苏科技大学,控制理论与控制工程,2014,硕士.
[14]胡松涛.热连轧自适应穿带模型的研究及应用[J].冶金自动化,2009,04:63-65+70.
[15]崔立靖.马克思主义自然观对生态危机的解读[D].吉林大学,马克思主义哲学,2004,硕士.
[16]罗伟.江西A财险公司发展战略问题研究[D].南昌大学,工商管理(专业学位),2012,硕士.
[17]解文银.SWOT分析框架下的DX社会组织创业中心的发展研究[D].南京大学,社会工作(专业学位),2013,硕士.
[18]巩睿.基于多模态超声图像的甲状腺肿瘤的分类[D].哈尔滨工业大学,计算机科学与技术,2013,硕士.
[19]黄娜.FDI对中国碳排放的影响研究:理论与实证[D].浙江工商大学,国际贸易,2012,硕士.
[20]郭凤双.巴达铁路D1K70+429~DK70+334段边坡抗滑桩设计[D].西南交通大学,地质工程,2013,硕士.
[21]陈雪慧.汉维谚语中比喻修辞对比研究[D].新疆师范大学,中国少数民族语言文学,2013,硕士.
[22]赵曜.县级纪检监察机关反腐败问题与对策研究[D].山东师范大学,公共管理(专业学位),2013,硕士.
[23]张海文.创造性叛逆视角下的阿赫玛托娃诗歌翻译研究[D].上海外国语大学,俄语语言文学,2013,硕士.
[24]刘立峰,孙赞东,杨海军,韩剑发,敬兵.缝洞型碳酸盐岩储层地震属性优化方法及应用[J].石油地球物理勘探,2009,06:747-754+783+648-649.
[25]周忠昊.天津市J制药有限公司产品营销策略研究[D].吉林大学,工商管理,2012,硕士.
[26]王振北.水处理絮凝工艺强化及颗粒形态控制技术研究[D].哈尔滨工业大学,城市水资源,2013,硕士.
[27]薛红.HMT家族新成员SET07生化特性及功能研究[D].中国人民解放军军事医学科学院,免疫学,2004,硕士.
[28]刘军平.中国古代立法解释探析[D].湘潭大学,刑法学,2003,硕士.
[29]位树.山区高速公路互通式立交变异形式及适用性[D].长安大学,交通运输工程(专业学位),2014,硕士.
[30]朱奇俊.ZJ市政府投资项目代建模式的分析和改进[D].西安工业大学,工商管理(专业学位),2014,硕士.
[31]周中坚.Web系统中分级用户安全管理的设计与实现[D].华中科技大学,通信与信息系统,2013,硕士.
[32]廖炯生.两状态非单调关联系统的形式理论[J].自动化学报,1988,04:301-310.
[33]高夯.中信证券网络安全建设方案[D].四川大学,电子与通信工程,2003,硕士.
[34]朱振伟.气象因素对电网负荷特性影响的研究[D].浙江大学,2008.
[35]曹乾坤.毛泽东自然观研究[D].江苏师范大学,马克思主义哲学,2013,硕士.
[36]张永强.基于混沌理论的电力系统短期负荷预测研究[D].沈阳理工大学,控制理论与控制工程,2013,硕士.
[37]王建.水稻种间杂种花粉不育的细胞学研究和不育基因的精细定位[D].南京农业大学,作物遗传育种,2013,硕士.
[38]蔡长利.管理层股权激励对R&D投入影响的实证研究[D].山东财经大学,会计学,2014,硕士.
[39]戴露.论地方政府公信力的提升[D].苏州大学,公共管理(专业学位),2012,硕士.
[40]于丽荣.中学德育方法推陈出新研究[D].河北大学,思想政治教育,2014,硕士.
[41]康胜武.基于粗集理论的属性处理方法和模糊规则提取及应用研究[D].厦门大学,2001.
[42]李智敏.连续波充填法充填侧支根管的临床观察[D].吉林大学,口腔临床医学,2014,硕士.
[43]王洪香.基于激光散射法对纳米颗粒测量的研究[D].哈尔滨理工大学,高电压与绝缘技术,2012,硕士.
[44]林益松.C航运公司波罗的海支线布局规划及其方案决策研究[D].上海交通大学,物流工程,2013,硕士.
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[46]刘长虎.我国股票价格指数功能研究[D].广西大学,工商管理,2004,硕士.
[47]张强.基于计算流体力学沥青路面水损害的细观分析[D].吉林大学,道路与铁道工程,2014,硕士.
[48]何春霞,李吉跃,张燕香,郑泉水,谢博,丁昳婷.5种绿化树种叶片比叶重、光合色素含量和δ~(13)C的开度与方位差异[J].植物生态学报,2010,02:134-143.
[49]薛佳梅.适用于宽电源范围Class D的若干重要模块设计[D].厦门大学,微电子学与固体电子学,2014,硕士.
[50]石运芝.雌性济宁青山羊生后性发育特性与雌孕激素及其受体关系的研究[D].山东农业大学,基础兽医学,2014,博士.

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