B7-H2基因3’-UTR内的单核苷酸多态性与胃癌发生相关性的研究

【摘要】
【作者】杨盼盼；
【导师】华东；汪维鹏；
【作者基本信息】苏州大学，肿瘤学，2014，硕士
【目的】研究B7-H2基因3’-UTR内的单核苷酸多态性（SNP）与胃癌发生的相关性，并进一步探讨胃癌组织中B7-H2表达下调的机制。
【方法】1.运用生物信息学软件筛选出位于B7-H2基因3’-UTR内的SNP位点及可能存在的miRNA结合位点；选择位于预测的miRNA结合位点内的，且较小等位基因频率(MAF)大于10%的SNP进行研究。2.收集183例胃癌患者及348例正常人的外周血样本，采用聚合酶链式反应-限制性片段长度分析法（PCR-RFLP）检测所收集的样本中该SNP的基因型分布，分析不同基因型与胃癌发生及临床病理参数的关系。3.采用双荧光素酶报告基因系统分析所预测的miRNA对B7-H2基因表达的调控作用，进一步探讨调控机制。
【结果】1.从SNP数据库中查找到40个位于B7-H2基因3′-UTR的SNP位点；较小等位基因频率(MAF)大于10%的SNP有rs15927，rs3804033，rs55769116，rs4819388和rs55769116，其中rs4819388位于miR-24与B7-H2基因3’-UTR结合区内，因此选取该SNP进行研究。2.数据分析显示SNPrs4819388与胃癌的发生密切相关。在胃癌患者中，GA杂合子所占比例明显高于GG纯合子（55.7%vs32.8%，OR=1.60，95%CI=1.08–2.37）；相对于GG纯合子，基因型为AA的个体发生淋巴结转移的可能性显著增高(OR=9.27，95%CI=1.16–74.2，p=0.017)，肿瘤细胞低分化的可能性更大(OR=8.16，95%CI=0.98–67.8，p=0.043)，TNM分期为III/IV期的可能性更大(OR=4.75，95%CI=1.01–22.4，p=0.046)；A等位基因在发生淋巴结转移（OR=1.76，95%CI=1.05-2.95，p=0.034）和/或TNM分期为III/IV期（OR=1.80，95%CI=1.07-3.04，p=0.032）的患者中的频率明显高于G等位基因。3.双荧光素酶报告基因系统分析结果显示miR-24可通过与B7-H2的3’-UTR结合而抑制其表达，且miR-24的抑制性作用是通过rs4819388产生的。
【结论】位于B7-H2基因3’-UTR内的SNPrs4819388，可影响miR-24对B7-H2表达的调控作用，与胃癌发生相关。
【关键词】B7-H2；单核苷酸多态性；miR-24；胃癌；

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