陆地棉高密度遗传图谱构建及衣分QTL定位

【摘要】棉花提供了世界上绝大多数天然纤维,同时还是植物蛋白和油脂的重要来源。棉属包括45个二倍体种(n=x=13)和5个异源四倍体种(n=2x=26)。棉属栽培种包括二倍体的亚洲棉和草棉,四倍体的陆地棉和海岛棉。陆地棉作为主要栽培种,占世界棉产量的95%以上。当前,培育高产优质棉花品种仍是棉花育种的重要目标。传统棉花遗传育种方法存在育种周期长、效率低等缺点,因而急需一种能提高育种效率的遗传改良方法。基于DNA标记技术的分子标记辅助育种方法,为棉花育种提供了快速、高效的遗传改良方法。分子标记辅助育种需要构建高密度的遗传图谱,并准确定位目标性状基因。目前陆地棉种内遗传图谱上遗传标记数量偏少,不能满足产量、纤维品质等性状的分子标记辅助选择要求。本研究在实验室前期利用陆地棉(渝棉1号×T586)重组近交系群体构建图谱的基础上,利用新筛选出的SSR标记,加密遗传图谱并定位衣分QTL。具体结果如下：1.亲本间标记多态性与群体基因型检测本研究利用2349对新SSR引物,以及早期已用于构建(渝棉1号×T586)重组近交系群体遗传图谱的23060对SSR引物,筛选亲本渝棉1号和T586之间的引物多态性,共新增引物475对。利用新增475对SSR多态性引物,检测(渝棉1号×T586)重组近交系群体的标记基因型,共获得489个标记位点。2.遗传图谱加密利用新增加的489个位点,与实验室前期获得的1572个分子标记,以及8个形态标记,共计2069个位点进行遗传连锁分析。构建了一张包括2019个标记位点的陆地棉种内遗传图谱,图谱总长度3592.2cM,标记间平均距离为1.8cM。其中A基因组992个位点,标记长度为1733.3cM,标记间平均距离为1.8cM；D基因组包括1027个位点,标记长度为1858.9cM,标记间平均距离为1.8cM。3.衣分QTL定位利用构建的高密度遗传图谱,结合2011年和2012年的衣分鉴定结果,共检测到7个衣分QTL,解释性状表型变异3.5%-52.7%。其中3个衣分QTL在2个环境中均能检测到,3个QTL与前人定位的QTL位置一致。6个QTL有利等位基因来源于渝棉1号,1个QTL有利等位基因来源于T586。
【作者】刘芳；
【导师】张正圣；
【作者基本信息】西南大学，作物遗传育种，2014，硕士
【关键词】陆地棉；高密度；遗传图谱；衣分；QTL；

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