哲罗鲑免疫球蛋白重链序列研究

【摘要】哲罗鲑在分类学上隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)、辐鳍亚纲(Actinopterygii)、鲱形总目(Clupeomorpha)、鲑形目(Salmoniformes)、鲑亚目(Salmonoidei)、鲑科(Salmonidae)、鲑亚科(Salmoninae)、鲑属(Salmo)。具有个体大、生长速度快、肉质细嫩鲜美、营养价值丰富等特点。目前我国内陆冷水水域分布有2亚种,有溯河型及纯淡水栖息种群之别。鱼类是最早出现免疫球蛋白的生物。免疫球蛋白基因序列在鱼类进化分界处表现出了很大的变化,并且鲑科鱼类起源于特殊的地理时期,因此对鲑科鱼类的免疫球蛋白基因序列进行研究,对古生物地理学、古生态学、气候变化及脊椎动物进化系统等许多方面均具有重要意义。就此,本文采用分子生物学和生物信息学相结合的方法,对哲罗(Huchotaimen)的免疫球蛋白重链可变区及恒定区序列进行研究和功能分析,并与虹鳟(Oncorhynchusmyki.ss)序列(Genbank登录号为S63348.1)进行相似性比较。从哲罗鲑主要免疫器官—脾脏获得总RNA并采用RT-PCR技术获得其免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)重链cDNA克隆,获得32条完整不重复可变区序列以及1条恒定区序列,经过BLUST网络对比,结果显示与GenBank报道的登录号为S63348.1的虹鳟序列的相似性高达87.4%以上；对所得核苷酸序列进行结构域可变性分析可见,哲罗鲑Ig重链可变区VH中骨架区(frameworkregion,FR)部分相对保守,变异率较低；互补决定区(Complementaritydeterminingregion,CDRs)变异率较大,特别是CDR3区变异可达35。免疫球蛋白重链可变区VH中D和J片段的的随机重排,外切酶的作用,以及在重排位点大量N,P片段的插入都大大增加了哲罗鲑免疫球蛋白重链可变区的多样性。恒定区序列与斑点叉尾鲴(Ictaluruspunctatus)、草鱼(Ctenopharyngodonidella)、虹鳟(Oncorhynchusmykiss)和大西洋鲑(Salmosalar)的免疫球蛋白进行比较后显示哲罗鲑和虹鳟及大西洋鲑的IgM亲缘关系比较近,据此推断本文获得哲罗鲑免疫球蛋白类型为IgM。
【作者】宿斌；
【导师】刘红柏；
【作者基本信息】南京农业大学，渔业，2013，硕士
【关键词】哲罗鲑；免疫球蛋白；可变区；恒定区；

【参考文献】
[1]肖化平,陈元平,杨凯科,魏晓林,孙立忠,钟建新.无序双层六角氮化硼量子薄膜的电子性质[J].物理学报,2012,17:532-538.
[2]张潇.基于跨层方法的异构网络智能网关优化算法研究[D].河南科技大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[3]高娣.基于B/S架构的区局办公系统的开发与应用[D].吉林大学,软件工程,2013,硕士.
[4]顾涛.中国民俗旅游的可持续发展研究[D].广西师范大学,2002.
[5]韩冬雷.基于Space系统指纹输入装置互操作技术的研究[D].首都师范大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[6]曹雪霞.GRP78在人肝细胞癌组织中的表达及临床意义[D].郑州大学,人体解剖学与组织胚胎学,2013,硕士.
[7]李伟.Copula函数在多变量洪水联合分布中的应用研究[D].华中科技大学,水利工程,2013,硕士.
[8]周路鸣,郭顺生.基于ERP的中小型制造企业供应商评估体系的建立[J].机械,2005,11:26-28+31.
[9]沈海澜.基于数据挖掘技术的电力负荷预测研究[D].中南大学,2003.
[10]刘金虹.基于模糊神经网络辨识技术的无刷直流电动机控制系统研究[D].浙江大学,控制理论与控制工程,2004,硕士.
[11]罗丽娟.中信银行信用卡库存管理模型研究[D].兰州大学,工商管理（专业学位）,2014,硕士.
[12]薄敏.罪刑配置阶段的刑罚目的研究[D].吉林大学,刑法学,2014,硕士.
[13]韩敏.化脂生发汤治疗雄激素源性脱发临床疗效观察[D].成都中医药大学,中医外科学,2012,硕士.
[14]欧爱萍.傅译《约翰·克利斯朵夫》与文学翻译基础理论应用研究[D].南京师范大学,法语语言文学,2012,硕士.
[15]蔡霞霞.新疆南疆城镇化发展的制约因素研究[D].塔里木大学,农村与区域发展,2013,硕士.
[16]王群.MIMO空分多址理论关键技术的可行性分析[D].南京邮电大学,通信与信息系统,2013,硕士.
[17]周庚如.高温超导微波器件在电子战中的应用[J].宇航计测技术.1993(01)
[18]葛云芳.运动编辑及其在虚拟环境中的应用[D].浙江大学,计算机应用,2004,硕士.
[19]班培刚.带通（BP）调节器及其在电子负载逆变侧控制中的应用研究[D].西安工程大学,检测技术与自动化装置,2013,硕士.
[20]张嘉敏.高速铁路能力计算与评估之理论与方法研究[D].北京交通大学,2012.
[21]王利平.滇产乌头属（Aconitum）草乌类药材的组织及显微鉴定方法研究[D].云南中医学院,生药学,2012,硕士.
[22]林伟.基于三维虚拟层合单元理论的钢筋混凝土框架结构仿真研究[D].南昌大学,结构工程,2012,硕士.
[23]李晓鹏.紫苏籽粒主要营养成分的提取与分离[D].中北大学,生物化工,2013,硕士.
[24]陈薇薇.初中古诗文背诵“真兴趣”培养初探[D].湖南师范大学,学科教学（专业学位）,2014,硕士.
[25]李岩,陈新中,杨炳儒.基于Web挖掘的智能门户搜索引擎的研究[J].计算机工程与应用,2002,04:34-36.
[26]罗红婷.对银行数据大集中形式下应用集中的探讨[J].金融会计,2005,05:51-52.
[27]陶林.移动Agent技术在电子商务中的应用研究[D].武汉理工大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[28]王建国,单踊,刘博敏,徐伟.转折年代“中国现代建筑教育摇篮”的继承者与开拓者们以东南大学建筑学院“新三届”学生发展研究为例[J].时代建筑,2015,01:18-25.
[29]郭楠.漂烫、预油炸对速冻马铃薯薯条品质影响的研究[D].中国农业机械化科学研究院,农产品加工及贮藏工程,2014,硕士.
[30]刘杨.从私人空间到敞开之地[D].河北师范大学,中国现当代文学,2014,硕士.
[31]钱欣.泪道激光联合引流管植入对泪道阻塞患者眼表的影响[D].苏州大学,眼科,2014,硕士.
[32]谢瑾仁.Internet密钥交换协议的分析改进与实现[D].兰州大学,计算机应用技术,2013,硕士.
[33]宋佳.呼和浩特市残疾人社会福利现状研究[D].内蒙古师范大学,社会工作（专业学位）,2012,硕士.
[34]杨璐溪.新鞘氨醇杆菌US6-1降解HMW-PAHs的代谢路径和转录调控研究[D].厦门大学,水生生物学,2014,硕士.
[35]王仲浩.SCDX新产品开发项目管理流程分析设计[D].电子科技大学,项目管理（专业学位）,2013,硕士.
[36]戴蕾宸.外商直接投资对中国就业的影响[D].南京大学,国际关系,2013,硕士.
[37]张国红.基于灰色关联模型的我国民营快递企业竞争力研究[D].东北财经大学,产业经济学,2012,硕士.
[38]徐志强.“用工”法律基本问题初论[D].西南政法大学,民商法学,2012,硕士.
[39]宋昕.二氧化碳共聚物应用材料产业链发展路径研究[D].吉林大学,企业管理,2013,硕士.
[40]苏胜男.基于硫酸根自由基降解水中有机污染物的研究[D].济南大学,2013.
[41]潘逸凡.降雨天气下高速公路交通安全风险评估及应急管理能力研究[D].长安大学,载运工具运用工程,2014,硕士.
[42]赵巍.信息时代的绘画艺术教育[D].河北大学,艺术学,2003,硕士.
[43]陈小波.红外图像增强技术研究[D].国防科学技术大学,电子与通信工程,2013,硕士.
[44]毛德健.基于激光消光法的小通道液固两相流参数检测研究[D].浙江大学,控制工程（专业学位）,2014,硕士.
[45]张立明.质量质心及转动惯量一体化测试系统设计[D].哈尔滨工业大学,飞行器设计,2013,硕士.
[46]焦建五.一种连续模型二维地电构造大地电磁测深反演方法[J].石油地球物理勘探,1990,01:63-70+126.
[47]李东阳.金砖国家在国际货币体系改革中的地位和作用[D].吉林大学,世界经济,2013,硕士.
[48]李博.基于电化学分子信标基因传感技术的HIV-1核酸检测新方法研究[D].南方医科大学,2012.
[49]侯莹莹.比较法视野下的网络通讯自由探析[D].山东大学,法律（专业学位）,2012,硕士.
[50]白旭云.企业R&D投入行为的Heckman两阶段分析——基于中国工业企业面板数据的实证研究[J].商业经济与管理,2014,05:85-96.