丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的分子生物学比较

【摘要】丁香假单胞菌黄瓜致病变种(Pseudomonassyringaepv.lachrymans)引起的黄瓜细菌性角斑病在世界范围内皆有发生,造成不同程度的损失,同时也引起甜瓜细菌性叶斑病。以往研究表明黄瓜和甜瓜细菌性角斑病的病原均为丁香假单胞茵黄瓜致病变种,但在本实验室的研究中发现,丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系在致病性和分子生物学上存在一定差异。本研究对黄瓜细菌性角斑病菌黄瓜株系和甜瓜株系的致病性分别进行了测定与比较,并利用多个看家基因研究了二者的分子生物学差异,设计特异性引物将这两种寄主上的分离物加以区分。获得了以下主要研究成果：对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的16SrRNA和16S-23SrRNA进行了测序并建立了系统进化树,同时对这两个株系的分离物进行了致病性测定,结果显示,两种不同株系分离物的16SrRNA和16S-23SrRNA同源性均高达99%,同时两种分离物在甜瓜和黄瓜上存在致病性差异,在原寄主上发病更为严重；说明丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系属于同一个种,但在致病性上存在差异。对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系的5个看家基因GAPDH基因、rpoD、rpoB、gyrB和gltA进行了序列测定并构建了系统发育树。系统发育分析表明,丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系分别聚在两个独立的分支簇里,说明两种分离物在遗传上存在明显差异。通过多重序列比较分析丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系和甜瓜株系以及丁香假单胞菌不同致病变种的GAPDH基因和ITS序列,分别设计了针对丁香假单胞菌黄瓜致病变种黄瓜株系的特异性引物(G-F/G-R)和甜瓜株系的特异性引物(ITS-F/ITS-R),两对引物均能把所有参试的这两个株系的菌株彼此区分。进一步证明了这2个株系可能为不同致病变种。综合上述结果,本研究建议将丁香假单胞菌黄瓜致病变种甜瓜株系命名为新的致病变种：丁香假单胞茵甜瓜致病变种Pseudomonassyringaepv.melonispathovarnov.。
【作者】代园凤；
【导师】胡白石；
【作者基本信息】南京农业大学，植物检疫与入侵生物学，2013，硕士
【关键词】丁香假单胞菌黄瓜致病变种；黄瓜株系；甜瓜株系；看家基因；系统发育；

【参考文献】
[1]薛晓燕.山东省农村信用社国际业务发展战略研究[D].西北大学,工商管理（专业学位）,2012,硕士.
[2]黎伟福.履带起重机桁架臂非线性强度及稳定性分析[D].吉林大学,机械工程,2014,硕士.
[3]彭帅.基于DSP的电动叉车交流驱动控制器的设计与实现[D].南京理工大学,控制理论与控制工程,2013,硕士.
[4]李白菊.一类双功能环己二胺类催化剂的合成及在不对称催化中的应用[D].西南大学,有机化学,2014,硕士.
[5]范菁.~(60)Co-γ辐射对茭白生长和生理特性的影响[D].浙江大学,蔬菜学,2012,硕士.
[6]谭克虎,邵宁荃.德国铁路股份公司运营模式研究[J].铁道运输与经济,2015,05:94-99+104.
[7]李建辉.钴铬合金与镁金属血管支架材料的电化学抛光工艺研究[D].西南交通大学,材料工程,2014,硕士.
[8]孙艺学.五味子素A、B对小鼠大脑脑室侧区神经发生的影响[D].吉林大学,基础兽医学,2014,硕士.
[9]谭晓丽.琥珀酸对惊厥幼鼠小脑浦肯野细胞电生理功能的影响[D].第四军医大学,中西医结合临床（专业学位）,2014,硕士.
[10]郭兆曾.步进电机锁相控制系统的分析和设计[J].自动化学报,1982,04:249-256.
[11]宋虎.低碳经济下绿色成本管理模式研究[D].沈阳理工大学,会计学,2012,硕士.
[12]丁碧婷.具有群体感应抑制活性的海洋细菌的筛选与活性物质研究[D].扬州大学,环境科学,2012,硕士.
[13]惠施宇.北京市东城区文化创意产业发展战略研究[D].首都经济贸易大学,企业管理,2014,硕士.
[14]万新.基于SA算法的移动无线传感网络协同避障方法研究[D].湖南大学,计算机技术,2012,硕士.
[15]程永强.基于微流控芯片和短毛细管的DNA片段快速电泳分离系统的研究[D].浙江大学,2010.
[16]王丹丹.法律视野下的林权概念解析[D].苏州大学,民商法学,2012,硕士.
[17]张义青.基底上石墨烯热振动分析[D].南京航空航天大学,一般力学与力学基础,2013,硕士.
[18]陈琴芳.草莓β-1，4-葡聚糖酶基因的克隆与遗传转化[D].湖南农业大学,植物病理学,2004,硕士.
[19]刘海玉.14793例患者颅内外动脉狭窄分布及其危险因素研究[D].吉林大学,临床医学,2013,硕士.
[20]方锐.过度振动微血管损伤及缺氧在声带良性病变中的致病机制[D].复旦大学,耳鼻咽喉科学,2013,博士.
[21]李娇娇.扭杆式双横臂独立前悬架的运动性能研究[D].沈阳工业大学,车辆工程,2013,硕士.
[22]胡曼.大规模风电厂的动态经济调度及其风险管理[D].南京大学,企业管理,2013,硕士.
[23]王润秋,郑桂娟,付洪洲,李青.地震资料处理中的形态滤波去噪方法[J].石油地球物理勘探,2005,03:277-282+16-372.
[24]宋庆雷.Cr、C对高铬铸铁等离子熔覆层及其微观组织的影响[D].中国矿业大学,材料加工工程,2014,硕士.
[25]丁广泉.我国慈善组织体制重塑法律问题研究[D].浙江大学,法律（专业学位）,2012,硕士.
[26]宋娜.生态界面设计研究[D].中国矿业大学,设计艺术学,2014,硕士.
[27]李国春.我国民间借贷立法研究[D].安徽大学,法律,2013,硕士.
[28]周春辉.强动荷载作用下流固耦合问题数值模拟[D].大连理工大学,固体力学,2013,硕士.
[29]李荣强.基于XML的夹具产品建模与共享技术研究[D].西北工业大学,机械制造及其自动化,2004,硕士.
[30]高博.环己二胺缩邻香兰素同核稀土配合物的合成、结构及其性能研究[D].黑龙江大学,有机化学,2013,硕士.
[31]蒋冕.青少年攻击性行为的成因分析及干预成效研究[D].苏州大学,发展与教育心理学,2013,硕士.
[32]陈根军,顾全.基于CIM的配电网一体化追踪拓扑[J].电力系统自动化,2009,03:59-63.
[33]周忠昊.天津市J制药有限公司产品营销策略研究[D].吉林大学,工商管理,2012,硕士.
[34]王慧.新型二芳基并1，3二氮卓及其衍生物抗食管癌活性的筛选及生物活性的研究[D].吉林大学,药物化学,2013,硕士.
[35]李超.鱼体模型目标强度的测定[D].大连海洋大学,捕捞学,2014,硕士.
[36]赵雷.网络化制造中的企业采购道德风险研究[D].兰州大学,企业管理,2013,硕士.
[37]曹冠贤.恩维尔与苏俄政府关系研究（1919-1922）[D].山西师范大学,世界史,2014,硕士.
[38]吴凤杰.房地产招投标管理系统的设计与实现[D].山东大学,软件工程（专业学位）,2013,硕士.
[39]石东也.县级职教中心的办学困境与对策研究[D].东北师范大学,课程与教学论,2012,硕士.
[40]焦生虎.中国铝业集团财务管理模式改进研究[D].兰州大学,工商管理（专业学位）,2013,硕士.
[41]朱军伟.菠菜低温保鲜关键技术的研究[D].上海海洋大学,食品科学与工程,2013,硕士.
[42]孙旭.南宋福州宗室文学研究[D].西南大学,中国古代文学,2013,硕士.
[43]钱黎娇.产品市场竞争对自愿性信息披露的影响研究[D].苏州大学,会计（专业学位）,2013,硕士.
[44]陈裴.自发性高血压大鼠的脑白质损伤及其相关机制[D].山东大学,神经病学,2013,硕士.
[45]孙玉红.慢性乙型肝炎治疗性疫苗的研究[D].重庆医科大学,儿科学,2004,硕士.
[46]张靖琳.山西省运城市资源型企业员工离职影响因素的实证研究[D].西南大学,企业管理,2014,硕士.
[47]李星星.学术虚拟社区成员关系社会网络研究[D].华中师范大学,情报学,2013,硕士.
[48]黎波.长株潭城市群住房公积金管理机制创新研究[D].湖南大学,公共管理,2014,硕士.
[49]葛丽丽.应用国产Amplatzer封堵器对成年女性房间隔缺损患者心脏重塑的影响[D].吉林大学,临床医学,2013,硕士.
[50]王义君.潍坊杨家埠木版年画民俗旅游开发研究[D].广西师范大学,民俗学,2013,硕士.