微卫星标记辅助大鳞副泥鳅育种研究

【摘要】大鳞副泥鳅(Paramisgurnusdabryanus)是我国一种重要的小型经济鱼类,并且具有较大的出口创汇潜力。近年来,随着捕捞强度的增加,大鳞副泥鳅的野生资源量正在逐渐减少,国内已经慢慢兴起了大鳞副泥鳅的养殖热潮。目前大鳞副泥鳅养殖的苗种主要来源于野生捕捞,优良的苗种稀缺。因此,为了持续、稳定和健康的发展大鳞副泥鳅养殖业,大鳞副泥鳅良种选育工作势在必行。本研究拟采用跨种扩增法和数据库挖掘方法,开发获得大鳞副泥鳅多态SSR,同时利用多态SSR标记对采集获得的群体进行遗传多样性分析；以各地理群体为基础选育群体,利用双列杂交方法,获得大鳞副泥鳅选育F1代,测量其生长陛状,进而评估各群体间生长性状的杂交效果。本研究旨在为大鳞副泥鳅生长性状良种的进一步选育打好基础。本研究的主要研究结果如下：1.大鳞副泥鳅微卫星标记的开发从来自于已发表文章获得的47对泥鳅的微卫星引物序列中,共筛选出了10对带型清晰、多态性较好的微卫星引物,适用于大鳞副泥鳅群体的跨种扩增,并对各对引物的PCR扩增退火温度进行了优化,引物名称、序列和退火温度。并进行琼脂糖检测。10个微卫星位点在大鳞副泥鳅群体的扩增都很好,PCR产物在PAGE电泳都可以产生清晰的条带。结果表明10个微卫星位点的等位基因数从8到12个不等,平均每个位点上含有9.9个等位基因；而有效等位基因数均小于等位基因数,介于4.1388到9.5410之间。10个微卫星位点的观测杂合度范围为0.0256～0.5500,平均为0.3459；而期望杂合度的范围为0.7682～0.9074,平均为0.8577。本研究初步认为,筛选出的10对泥鳅微卫星标记是适用于大鳞副泥鳅的,可以作为其遗传学研究的良好标记。2.不同地理群体大鳞副泥鳅的遗传多样性分析在大鳞副泥鳅4个地理群体中,共检测到95个等位基因,平均每个位点检测出9.5个等位基因。群体的平均等位基因数目在5.200-10.000,位点的多态信息含量PIC在0.546-0.803,属于中度到高度多态位点,等位基因数最少的为河南群体,最多的为安徽群体,群体的期望杂合度HE在0.767-0.874,最低的是河南群体,最高的是安徽群体,平均值为0.836。群体观察杂合度Ho在0.242-0.327,最低的为湖北群体,最高的为湖南群体,平均值为0.284。安徽群体的等位基因数目A和期望杂合度HE均为最大。由此可见,安徽群体的遗传多样性水平高于其他地区的群体。固定指数Fis表明这四个群体均表现为杂合子缺失(Fis>0)。Hardy-Weinberg平衡检验表明各群体至少有5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。在Mac229-SSR、Mac425-SSR和Mac477-SSR位点所有的群体均偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。根据DA遗传距离构建系统树,UPGMA聚类显示四个地理群体主要聚为3类,湖北、安徽群体遗传距离较小首先聚为一类,后与湖南群体聚为一类,而河南群体则单独聚为一类。3.不同地理群体大鳞副泥鳅的繁殖与子代生长性状配合力的分析在7个不同杂交或自交组合中,湖北群体自交种群获得的子代全长、体长、体高、体厚和体重最大,明显高于其他组合。其次为河南种群群体内自交获得的子代。河南种群作为母本和辽宁种群作为父本杂交获得的子代全长等生长性状数值最小。方差分析结果显示,父本、母本和父本×母本均方都达到极显著水平(P<0.01),说明父母本的全长、体长、体高、体厚和体重的一般配合力(GCA)效应间均存在极显著差异,并且特殊配合力(SCA)也存在着极显著的遗传差异。一般配合力是指某一亲本与其他亲本配成的几个F1的平均产量和所有组合的F1的总平均值的差值,特殊配合力分析是指某特定组合的平均值与其双亲的一般配合力的差值。前者主要受基因加性效应的影响,后者受基因的显性效应和上位效应影响。结果显示,父本全长、体长、体高、体厚和体重的一般配合力(GCA)效应值大小依次为湖北种群、湖南种群、河南种群、安徽种群、辽宁种群。母本全长、体长、体高、体厚和体重一般配合力效应值由大至小依次为湖北种群、河南种群。湖北种群父本一般配合力效应值大多为正值,说明利用湖北的大鳞副泥鳅作为父本较容易配出具有生长优势组合。在特殊配合力分析中,河南种群内杂交组合相对效应值最大,其次为湖北种群内杂交组合,最小的为河南种群作为母本与湖北种群作为父本的组合。
【作者】陈钢铭；
【导师】王卫民；
【作者基本信息】华中农业大学，水产养殖，2014，硕士
【关键词】大鳞副泥鳅；微卫星标记；生长性状；遗传多态性；配合力；

【参考文献】
[1]许玮玮.乡镇公务员职业倦怠问题研究[D].辽宁大学,行政管理,2012,硕士.
[2]余敏.EPS自动包装机开袋装置动力特性研究[D].湖北工业大学,机械设计及理论,2014,硕士.
[3]迟硕.中国自然垄断行业法律规制问题研究[D].复旦大学,法律,2012,硕士.
[4]沙金,谢林生,韩晶杰,张霞,张国勋.液相法制备石墨烯薄片的研究[A].中国化学会高分子学科委员会.2009年全国高分子学术论文报告会论文摘要集（上册）[C].中国化学会高分子学科委员会:,2009:1.
[5]黄宗玉.类石墨烯二硫化钼的第一性原理研究[D].湘潭大学,2014.
[6]纪美玲.论我国公民的迁徙自由权[D].安徽大学,法律,2014,硕士.
[7]刘冰洁.20世纪60-80年代埃及住房问题研究[D].北京外国语大学,阿拉伯语语言文学,2014,硕士.
[8]郭晓佳.高中教师教学设计能力现状的调查研究[D].山西师范大学,课程与教学论,2014,硕士.
[9]束远光.人道主义干涉下的国际人权保护研究[D].黑龙江大学,国际法学,2013,硕士.
[10]夏浩.工业级规格喷射成形7055铝合金的组织演变与力学性能[D].兰州理工大学,材料加工工程,2013,硕士.
[11]王伟.过敏性紫癜患者血清IL-10、IL-26水平的变化及其意义[D].河北医科大学,皮肤病与性病学,2014,硕士.
[12]梅海舟.基于TDC-GP21型超声波流量计的开发与研究[D].华南理工大学,机械工程,2012,硕士.
[13]胡霞.对中国当代风景油画中人文关怀的思考[D].湖南师范大学,美术学,2014,硕士.
[14]方钰文.我国工伤认定中的法律问题研究[D].安徽大学,法律,2014,硕士.
[15]肖雅.专用通信网络监测评估系统的设计与实现[D].华中科技大学,电子与通信工程,2013,硕士.
[16]会国涛,张化光,汪刚,解相朋,吴振宁.模糊双曲正切模型研究综述[J].自动化学报,2013,11:1849-1857.
[17]牛玉广,邓亮.一种改进的关联规则混合挖掘算法[J].微机发展,2005,11:143-145.
[18]樊丹.高中生语篇能力与英语阅读理解的相关性研究[D].沈阳师范大学,外国语言学及应用语言学,2013,硕士.
[19]周亚蓉.核电级高纯硼酸的制备工艺研究[D].大连理工大学,化学工程（专业学位）,2013,硕士.
[20]曹璐.白藜芦醇自微乳的研制[D].河北医科大学,药剂学,2014,硕士.
[21]马仁娜.沿海内贸班轮运输系统中的空箱调运策略研究[D].大连海事大学,物流工程,2014,硕士.
[22]董宏伟.中国房地产投资信托基金（REITs）税收法律制度研究[D].浙江工商大学,经济法学,2013,硕士.
[23]王星晨.连续刚构桥零号块温度应力分析研究[D].长安大学,桥梁与隧道工程,2014,硕士.
[24]刘珩,潘景铭,唐小我.基于损失厌恶型零售商的易逝品供应链价格补贴契约研究[J].控制与决策,2010,08:1149-1154.
[25]苑鹤,孙萌,王卫娜,吴秋华,王春,王志.石墨烯磁性纳米粒子固相萃取-火焰原子吸收联用测定水样中的痕量铜[A].中国化学会色谱专业委员会、北京色谱学会.全国生物医药色谱及相关技术学术交流会（2012）会议手册[C].中国化学会色谱专业委员会、北京色谱学会:,2012:2.
[26]黄乔坤.我国民营科技企业技术创新模式选择与对策研究[D].安徽大学,工商管理,2013,硕士.
[27]景武堂.生长抑素治疗粘连性肠梗阻的疗效分析[D].兰州大学,外科学,2013,硕士.
[28]毛斌.家具企业加盟店产品资源模块化研究[D].中南林业科技大学,家具与室内设计工程,2013,硕士.
[29]慕德俊,戴冠中.Systolic算法和结构求解线性系统的极点配置问题[J].自动化学报,1995,05:586-591.
[30]王琪.明清小说与韩国汉文小说女将形象比较研究[D].大连大学,中国古代文学,2014,硕士.
[31]徐彬荣.综合决策支持系统在企业竞争情报中的战略地位[J].情报资料工作,2004,06:68-70.
[32]张琼.RNA干扰抑制人肺腺癌耐药细胞A549/DDP的ERCC2基因表达的研究[D].遵义医学院,肿瘤学,2012,硕士.
[33]田文雅.大学生思想政治教育生活化的价值研究和路径分析[D].山西师范大学,马克思主义理论,2013,硕士.
[34]余烨,曹明伟,岳峰.EVibe:一种改进的Vibe运动目标检测算法[J].仪器仪表学报,2014,04:924-931.
[35]冯艳虹.IGBT逆变桥无源无损缓冲电路的研究[D].华北电力大学（北京）,电力电子与电力传动,2004,硕士.
[36]雷梅.社会认同与自我建构[D].湖北大学,英语语言文学,2011,硕士.
[37]田沛霖.产谷氨酰胺转胺酶的茂原链霉菌的发酵优化及诱变育种[D].华东师范大学,生物化学与分子生物学,2013,硕士.
[38]马克.多品种小批量成长型制造业精益ERP研究与实现[D].浙江理工大学,机械制造及其自动化,2014,硕士.
[39]于志君.危机事件中门户网站的图片传播机制研究[D].山东师范大学,传播学,2013,硕士.
[40]宿伟娜.中国上市公司内部控制自我评价研究[D].山东大学,会计（专业学位）,2013,硕士.
[41]李超.一种用户主导的软件开发方法研究[D].中国科学院研究生院（软件研究所）,2002.
[42]柯清平,李广录,郝天歌,何涛,李雪梅.超疏水模型及其机理[J].化学进展,2010,Z1:284-290.
[43]解智慧.一种新的介导细胞间粘附的肌动蛋白相关蛋白KIAA1522在食管癌中作用及其机制的研究[D].北京协和医学院,细胞生物学,2014,博士.
[44]伍盛.轻骨料混凝土L形截面异形柱正截面承载力研究[D].广西大学,结构工程,2004,硕士.
[45]蒋其垲.静悄悄的革命——再论信息、信息技术与石油工业[J].石油科技论坛,2002,02:23-28.
[46]邓小清,杨昌虎,张华林.B/N掺杂对于石墨烯纳米片电子输运的影响[J].物理学报,2013,18:340-347.
[47]苏保河.一类可修系统的可靠性指标和最优检测策略[J].自动化学报,2002,01:116-119.
[48]车媛媛.空气源跨临界CO_2热泵热水器系统的性能研究[D].大连理工大学,化工过程机械,2013,硕士.
[49]杨军.基于同步对话的CSCL学习协同过程的评价指标与引导策略研究[D].首都师范大学,现代教育技术,2014,硕士.
[50]薛雪.山东省公立医院管办分开改革研究[D].山东大学,公共管理（专业学位）,2013,硕士.