KCNQ1OT1基因多态性与肝细胞肝癌易感性关联研究及初步功能分析

【摘要】目的：研究KCNQ1OT1(KCNQ1overlappingtranscript1)基因编码区的一个四核苷酸重复序列多态（rs35622507）与中国人群肝细胞肝癌（HCC）易感性的关联，并利用基因型-表型关联研究及生物信息学方法探讨多态参与肝细胞肝癌发生的功能及意义。方法：（1）运用生物信息学工具筛选出KCNQ1OT1基因编码区的多态，并从中选取一个具有潜在功能的短串联重复序列（STR）多态基因座（rs35622507）作为候选多态；（2）采用病例对照研究方法（510HCC病例和1014正常对照），PCR扩增结合非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对候选多态进行基因分型，Logistic回归统计分析基因多态基因座与HCC的关联性；（3）运用RealtimePCR研究四种肝癌细胞系（HepG2,Hep3B,SK-Hep-1,BEL-7704）中rs35622507多态与KCNQ1OT1以及细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1C(CDKN1C)表达量的基因型-表型关联；（4）运用生物信息学的方法预测rs35622507多态对KCNQ1OT1空间构象的影响。结果：(1)基因分型结果显示，位于KCNQ1OT1编码区的rs35622507基因座具有较好的多态性，病例组和对照组中rs35622507基因座的等位基因频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）（2）调整性别、年龄、吸烟、饮酒、HBV感染等主要风险因素后，运用Logistic回归分析的方法对实验数据进行统计分析，统计结果显示：携带一个等位基因10的杂合子或者是不带等位基因10的基因型个体相对于10-10纯合子患HCC风险性明显降低（OR=0.67，95%CI：0.53–0.86；OR=0.38，95%CI：0.21–0.69）。（3）Real-timeRT-PCR结果显示，STR基因型与KCNQ1OT1的表达有基因型表型相关性，在四个细胞系中KCNQ1OT1基因中不带等位基因10的基因型在细胞系中的表达量分别明显增高20.9和33.3倍。另外在三个肝癌细胞系中KCNQ1OT1的表达量与抑癌基因CDKN1C的表达量呈负相关。（4）生物信息学预测结果提示，STR多态可能通过不同等位基因改变KCNQ1OT1的空间构象从而影响KCNQ1OT1和CDKN1C的表达进而参与HCC的发生。结论：（1）中国人群中rs35622507多态与肝细胞肝癌易感性存在显著关联；（2）肝癌细胞系中rs35622507多态与KCNQ1OT1以及CDKN1C的表达量之间存在显著的基因型-表型关联；（3）rs35622507多态可能通过影响KCNQ1OT1的空间构象，从而实现对KCNQ1OT1以及CDKN1C表达的调控，进而参与HCC发生。
【作者】万姣；
【导师】卞士中；高玉振；
【作者基本信息】苏州大学，法医学，2014，硕士
【关键词】KCNQ1OT1基因；CDKN1C基因；rs35622507；肝细胞肝癌；短串联重复序列；

【参考文献】
[1]孔明.重组TNF-α人源单克隆抗体对食蟹猴长期毒性及机制研究[D].第二军医大学,卫生毒理学,2013,硕士.
[2]战立堂.硼氮掺杂石墨烯的导电性和电荷分布的研究[D].辽宁师范大学,2013.
[3]冯桂英.超声联合微泡对肝断裂伤止血作用的实验研究[D].广州医科大学,影像医学与核医学（专业学位）,2014,硕士.
[4]许泽清.苯甲酸衍生物功能化聚苯乙烯-Eu(Ⅲ)配合物的制备及其光致发光性能研究[D].中北大学,应用化学,2014,硕士.
[5]孙丽丽.水溶性人参寡糖改善东莨菪碱诱导的学习障碍及相关机制研究[D].吉林大学,生理学,2013,硕士.
[6]尚金成,周劼英,程满.兼顾安全与经济的电力系统优化调度协调理论[J].电力系统自动化,2007,06:28-33.
[7]瞿洋.我国检察机关绩效考评体系研究[D].天津大学,公共管理,2013,硕士.
[8]王清丽.资源三号遥感数据在基础地理信息数据生产的应用研究[D].西安科技大学,测绘工程,2014,硕士.
[9]陈进.我国中小商业银行网络化发展战略的思考[D].南京理工大学,2003.
[10]吴蕾.采用微卫星标记与克隆16S rRNA基因的方法分析管角螺不同种群遗传多样性[D].宁波大学,生物化学与分子生物学,2014,硕士.
[11]毕玉胜.高管团队注意力配置与企业国际化战略选择[D].兰州大学,企业管理,2013,硕士.
[12]迟桂友,冯彦民,杨中方.S5-115UPLC在承钢棒材连轧冷床控制系统中的应用[J].冶金自动化,1997,02:17-19.
[13]周非.马克思主义哲学中人的地位[D].吉林大学,马克思主义哲学,2014,硕士.
[14]郑锦华.基于牺牲空间策略分子印迹杂化物的设计、合成与应用[D].福建师范大学,2014.
[15]覃宇.公共管理视域下的新媒体功能研究[D].武汉科技大学,行政管理,2012,硕士.
[16]倪立宠.硫化促进剂的合成新工艺研究[D].浙江工业大学,化学工程,2012,硕士.
[17]刘鹏.丙戊酸钠对Kasumi-1细胞裸鼠移植瘤生长抑制作用及机制探讨[D].承德医学院,肿瘤学,2011,硕士.
[18]李杭.SC公司筹资活动的内部控制案例研究[D].首都经济贸易大学,会计（专业学位）,2014,硕士.
[19]贺辉群.乐天与自由的吉普赛风[D].中国音乐学院,音乐学,2012,硕士.
[20]刘艳华,辉敏敏,李明.农户信贷配给程度的空间异质分析[J].农业经济问题,2014,07:52-59+111.
[21]王晓卿.计算机化髁突运动轨迹描记仪对个别正常（牙合）受试者前伸髁导斜度的测量[D].大连医科大学,口腔临床医学,2012,硕士.
[22]吕建党.超高压线路单相接地故障判别研究[D].西安科技大学,电气工程,2014,硕士.
[23]仝晋.特殊防卫权的合宪性分析[D].苏州大学,宪法学与行政法学,2013,硕士.
[24]马兰兰.强迫交易罪客观行为研究[D].西南政法大学,刑法,2012,硕士.
[25]汤娟娟.中国共产党民族复兴思想研究[D].安徽大学,马克思主义基本原理,2014,硕士.
[26]吴迪.高中英语写作任务型学习环境设计研究[D].东北师范大学,教育技术学,2012,硕士.
[27]郝国芳.乌海市高中信息技术课教学存在的问题及对策研究[D].内蒙古师范大学,教育（专业学位）,2013,硕士.
[28]游贵荣.构筑企业智能管理信息系统[J].福建商业高等专科学校学报,2002,04:12-13.
[29]于正凯.价值与关系：网络媒体商业模式研究[D].复旦大学,媒介管理学,2013,博士.
[30]孔德勇,梁斌,云慧,王爱杰,任南琪.生物阳极及其反转为生物阴极降解氯霉素[J].环境科学,2015,04:1352-1358.
[31]王节.甘肃省产业经济系统演化的混沌性分析[D].兰州大学,数量经济学,2013,硕士.
[32]朱日祥,徐义刚,朱光,张宏福,夏群科,郑天愉.华北克拉通破坏[J].中国科学:地球科学,2012,08:1135-1159.
[33]曹建华.基于相变材料的锂离子电池热管理系统研究[D].清华大学,动力工程及工程热物理,2013,硕士.
[34]王蕾.基于不同收入水平农户的农田水利设施供给效果研究[D].西北农林科技大学,农业经济管理,2014,博士.
[35]刘丹丹.肉仔鸡对不同来源菜籽粕氨基酸消化率的影响[D].甘肃农业大学,动物营养与饲料科学,2013,硕士.
[36]郑珂.石家庄市中职生职业价值观现状调查研究[D].河北师范大学,职业技术教育学,2013,硕士.
[37]吴华.自体肌腱重建前交叉韧带腱骨愈合早期的组织学观察与相关生物力学变化的研究[D].苏州大学,外科学（专业学位）,2013,硕士.
[38]高英志,汪诗平,韩兴国,陈全胜,王艳芬,周志勇,张淑敏,杨晶.退化草地恢复过程中土壤氮素状况以及与植被地上绿色生物量形成关系的研究[J].植物生态学报,2004,03:285-293.
[39]张小于.配料车导航系统研究与开发[D].宁夏大学,机械制造及其自动化,2014,硕士.
[40]杨欢.~(131)I-rFliC的制备及乳腺癌荷瘤鼠体内生物学分布特征[D].山东大学,影像医学与核医学,2013,硕士.
[41]王一玲.我国进口食品安全监管问题研究[D].华中师范大学,公共管理,2014,硕士.
[42]张超生.目标成本法及其案例研究[D].武汉大学,2003.
[43]张曙光.美元化对拉美经济的影响[D].外交学院,国际关系,2004,硕士.
[44]史迪.韩国小学汉语课堂教学研究[D].沈阳师范大学,汉语国际教育,2013,硕士.
[45]张梅芳.成人高等函授学员学习效果的研究[D].南京师范大学,成人教育学,2012,硕士.
[46]孙开县.推进我国监狱服刑罪犯社会化管理研究[D].云南财经大学,公共管理,2013,硕士.
[47]李明.高职院校学前教育专业音乐教学现状分析及对策初探[D].辽宁师范大学,学科教学（专业学位）,2012,硕士.
[48]张青天.石墨烯中自旋相关量子输运的研究[D].中国科学技术大学,2013.
[49]宋庆亮.基于可持续发展理论的物流园区发展评价研究[D].长安大学,物流工程与管理,2013,硕士.
[50]黄玲.论近代中国的海外修学旅游[D].湘潭大学,专门史,2003,硕士.