猪诱导干细胞多能性维持机理的研究

【摘要】本研究利用microarray和RNA-seq等手段，对从国内外不同实验室来源的猪iPS细胞株进行了测定分析，获得了多维度的基因表达数据,并通过系统生物学整合分析深入探讨了猪iPS细胞多能性维持的分子机理。利用基因芯片初步鉴定重编程完成情况，同时与已报道建系猪iPS基因表达谱比较，探讨猪iPS细胞多能性维持的调控网络。结果表明完全重编程的iPS细胞比部分重编程的iPS细胞高表达EPCAM，该基因可作为诱导猪多能性细胞的标记物。通过比较JAK-STAT,NOTCH,TGFB1,WNT和VEGF通路相关基因在猪、人和小鼠多能性细胞中的表达情况，解析了猪多能性和自我更新维持的特性。nave状态特异的标记基因KLF2/4/5和TBX3在猪iPS中没有上调，但primed状态的标记基因OTX2和FABP7在猪iPS中上调。同时，DLK1-DIO3相关基因在猪iPS中异常表达，这能够解释目前较少有嵌合猪产生的报道。这些结果表明目前诱导和培养体系下得到的猪iPS接近于人，而区分于小鼠多能性维持状态。利用通过RNA-seq比较了猪iPS细胞和成体细胞的基因表达谱，同时分析了不同生长因子依赖的猪iPS细胞基因表达谱的差异，这些差异基因可能为鉴定猪iPS细胞多能性维持的关键转录因子提供参考。对分析出的差异基因进行功能富集分析，从而揭示与猪多能性维持相关的重要细胞信号通路和代谢活动。分析结果表明猪iPS上调基因富集与“核糖体”，“染色质重塑”以及“细胞周期”等通路。我们的分析表明RNA剪接对于调控猪细胞的多能性具有关键作用，推算出了猪iPS细胞和成体细胞中出现的可变剪切体。我们以多能性维持核心转录因子SALL4为例说明了其可变剪切的模式，并通过RT-PCT和定量PCR进行了验证。本文最后分析了猪iPS中上调基因在猪早期胚胎发育过程中动态表达的情况。由此，建立了猪多能性维持的基因表达图谱，以上分析对于建立Nave状态的猪iPS细胞系具有参考意义。
【作者】刘亚军；
【导师】王华岩；
【作者基本信息】西北农林科技大学，细胞生物学，2014，博士
【关键词】猪；iPS；RNA-seq；Nave状态；多能性；

【参考文献】
[1]屈鹏献.我国预算分权制度研究[D].甘肃政法学院,宪法学与行政法学,2012,硕士.
[2]苏伟.移动互联网路由理论与关键技术的研究[D].北京交通大学,2008.
[3]王智涛,胡伟,夏德明,梅生伟,赵立民.东北500kV电网HAVC系统工程设计与实现[J].电力系统自动化,2005,17:85-88.
[4]进步升.财务在高校管理中的作用及地位研究[D].内蒙古师范大学,思想政治教育,2012,硕士.
[5]刘钟淇,宋强,刘文华.基于模块化多电平变流器的轻型直流输电系统[J].电力系统自动化,2010,02:53-58.
[6]柴丹.基于PROFIBUS-DP的嵌入式安全Web网关的设计与实现[D].吉林大学,通信与信息系统,2014,硕士.
[7]王承禄.台湾省渔业交流考察报告[J].现代渔业信息.1996(10)
[8]刘琢扶.性激素及其受体在鼻咽纤维血管瘤发病机制中的作用[D].复旦大学,耳鼻喉头颈外科,2013,博士.
[9]俞贝妮.浅析场所精神理论对博物馆设计的启示[D].浙江理工大学,设计艺术学,2012,硕士.
[10]王琳.《管制知识：网络世界中的信息自由和隐私保护》（第三章）翻译报告[D].四川外国语大学,翻译,2014,硕士.
[11]姜曰文.农村公路冷再生沥青路面材料和结构研究[D].长安大学,道路与铁道工程,2014,硕士.
[12]刘永玲.基于ARM9和Linux的人脸识别系统的研究[D].北京交通大学,2013.
[13]张建梅.张沛霖主任学术思想、临床经验总结及治疗急性基底节区脑梗塞临床研究[D].云南中医学院,针灸推拿（专业学位）,2011,硕士.
[14]檀秀云.从生态角度解读海明威的短篇小说[D].河北师范大学,英语语言文学,2012,硕士.
[15]何富安,张黎明.综述原位聚合法制备高性能聚乙烯基复合材料[J].石油学报(石油加工),2015,02:369-389.
[16]马润津.非平稳ARMA模型自校正预报器及其应用[J].自动化学报,1985,03:267-273.
[17]董玲娜.耳穴压丸法对剖宫产术后疼痛及相关介质影响的临床研究[D].浙江中医药大学,临床护理学,2014,硕士.
[18]郭懿萱.鄂尔多斯盆地安塞油田三叠系延长组长7油层组沉积相及储层特征研究[D].西北大学,矿物学、岩石学、矿床学,2013,硕士.
[19]云丹丹.自由现金流量折现模型在企业价值评估中的应用研究[D].河北大学,资产评估（专业学位）,2014,硕士.
[20]张翼飞.现代性与乌托邦[D].浙江大学,政治学理论,2012,博士.
[21]白倩.公司治理对会计稳健性影响的实证研究[D].首都经济贸易大学,会计学,2013,硕士.
[22]王孟杰.生物能开发与利用[J].科技导报.1993(07)
[23]严尔林.超复接器——一种新的数字复接方式[J].现代电信科技.1996(11)
[24]王蔚.平安保险公司团体健康保险产品策略研究[D].西安理工大学,工商管理,2004,硕士.
[25]卫立现,杜骁勇,李涛,李珊.石墨烯领域中国专利申请状况分析[J].中国发明与专利,2013,05:57-61.
[26]韩启纲.模糊控制原理、设计及应用　第7讲高级模糊控制器的设计[J].冶金自动化,1996,01:50-54.
[27]王琛.美国电视剧推广策略研究[D].南京师范大学,传播学,2012,硕士.
[28]孙飞.痔洗康Ⅲ号降低肛周尖锐湿疣术后复发率的临床观察[D].黑龙江中医药大学,中西医结合临床（专业学位）,2014,硕士.
[29]刘世荣,常建国,孙鹏森.森林水文学:全球变化背景下的森林与水的关系[J].植物生态学报,2007,05:753-756.
[30]陈铭.宽带MIMO系统衰落信道上高效空时频码的性能研究[D].杭州电子科技大学,通信与信息系统,2012,硕士.
[31]李忠秋.SJY公司设计质量控制对策研究[D].吉林大学,工业工程,2012,硕士.
[32]周涛.基于反双曲正弦函数的跟踪微分器[J].控制与决策,2014,06:1139-1142.
[33]赵昆.WTO框架下自然资源出口限制措施研究[D].辽宁大学,法律,2012,硕士.
[34]王世鹏.图的b色数和外控制数[D].新疆大学,应用数学,2013,硕士.
[35]刘志强.基于应用服务器的企业级应用安全体系的研究[D].西北工业大学,计算机应用技术,2004,硕士.
[36]张叔伦,陈静,张关泉.逆时偏移的方向导数算法[J].石油地球物理勘探,1991,06:673-678+799.
[37]吴闵.论现代雕塑创作中时尚元素的视觉表现与运用[D].广西艺术学院,美术学,2014,硕士.
[38]蔡茵.BNP对冠心病患者非心脏手术围术期心血管事件的预测价值[D].河北医科大学,内科学（专业学位）,2014,硕士.
[39]舒湘沅.飞机型号研制项目管理知识体系研究[D].西北工业大学,管理科学与工程,2004,硕士.
[40]赵耀虹.冷战时期美国对东欧的援助政策（1945-1968）[D].华中师范大学,国际关系史,2014,硕士.
[41]缪黎鹏.SS3B型机车网络系统的运用及改进研究[D].西南交通大学,车辆工程,2013,硕士.
[42]王磊.北京市幼儿园历史文化教育现状的调查研究[D].首都师范大学,课程与教学论,2013,硕士.
[43]李欣杰.大东沟泥石流风险性评价研究[D].吉林大学,地质工程,2014,硕士.
[44]冯为国,田宏,刘志国.TXS系列三相电源相序调整保护器[J].铁道通信信号.2001(12)
[45]娄雪儿.汉日同素逆序词的对比研究及相关词的教学建议[D].上海外国语大学,语言学及应用语言学,2013,硕士.
[46]邱鹏超.上转换@介孔SiO_2多功能纳米复合体系构建及肿瘤诊疗研究[D].湖南大学,2014.
[47]周玉昕.虚拟数控加工系统的切削仿真及加工结果评价研究[D].广东工业大学,机械电子工程,2013,硕士.
[48]张成杰.内蒙古电视台《百姓热线》探析[D].内蒙古大学,新闻与传播,2014,硕士.
[49]鞠斯文.日本同意杀人罪的规定及其对我国的启示[D].吉林大学,法律,2013,硕士.
[50]杨诗卫.70t级黄磷罐车研究[D].西南交通大学,车辆工程,2013,硕士.