BSG和CKIP-1基因多态性与中国汉族人群慢性充血性心力衰竭易感性的关联研究

【摘要】目的Basigin(BSG)又称为CD147或细胞外基质金属蛋白酶诱导因子(extracellularmatrixmetalloproteinase-inducer,EMMPRIN),与恶性肿瘤的浸润与转移、心血管结构重构、炎症反应以及细胞组织的分化和发育密切相关。本研究旨在查明健康中国汉族人群中BSG基因的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)分布及其连锁不平衡情况。方法随机收集48例健康、无亲缘关系的中国汉族人外周血液并提取基因组DNA,设计引物对所有个体BSG基因的启动子区、外显子区和外显子内含子交界区的序列进行PCR扩增和正反向测序,通过判读测序峰图,明确SNP的发生情况及其频率；通过Hardy-Weinberg平衡分析、单倍型推测和连锁不平衡分析,确定BSG基因位点的单倍型标签SNP(haplotypetagSNP,htSNP);中性理论检验查明该基因位点SNP频率分布是否符合选择中性。结果BSG基因位点共发现21个SNP,其中包括2个新发现的SNP6978G>A和7949C>T；发掘到的17个常见SNP只有7个出现在HapMap数据库中；所有SNP位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。根据连锁不平衡结构,该基因位点共推测出4个单倍型域,确定其中9个SNP为单倍型标签SNP(haplotypetagSNP,htSNP)。中性理论检验结果提示健康中国汉族人群BSG基因的SNP分布符合中性进化假说(Tajima’sD=1.75,P>0.05;D*=0.48,P>0.1;F*=1.14,P>0.1)。结论1)本研究首次对中国健康汉族人群BSG基因的SNP进行了发掘,发现其2个新的SNP。2)中国健康汉族人群BSG基因的SNP分布符合中性进化假说。3)中国汉族人群BSG基因位点共确定有9个单倍型标签SNP,为在该群中研究BSG基因多态性与疾病易感性或药物反应性个体差异奠定了基础。目的查明中国汉族人群中BSG基因多态性与慢性心衰(chroniccongestiveheartfailure,CHF)遗传易感性的关联关系。方法收集770例CHF住院患者以及与之年龄、性别相匹配486例汉族健康成年人的外周静脉血标本,酚氯仿抽提法提取所有受试者外周血DNA。通过PCR产物Sanger测序对BSG基因的4个单倍型标签单核苷酸多态性(SNP)rs1803202C>T、rs2229664C＞G、rs4919862C＞T和rs8259A>T进行基因分型；同时收集两组人群的临床和实验室检查指标。Logistic回归分析每个位点SNP与CHF易感性间的关联关系。结果在所有的CHF病例和对照人群中,rs1803202C＞T、rs2229664C＞G、rs4919862C＞T和rs8259A>T四个SNP位点低频等位基因及各位点基因型的频率分布无明显差异；以是否吸烟以及CHF患者是否合并高血压进行分层分析发现,在非吸烟人群与非高血压人群中,与rs8259AA纯合子基因型个体相比较,携带rs8259T等位基因的个体心衰的发生风险显著升高(非吸烟人群中：OR=1.357,95%可信区间为1.01-1.82,P=0.042；非高血压人群中：OR=1.777,95%可信区间为1.30-2.43,P<0.001)。通过对CHF的危险因素进行校正,发现rs8259T等位基因升高CHF发病风险的作用仍具有显著意义(非吸烟人群：OR=1.82,95%可信区间为1.011-1.821,P=0.017；非高血压人群：OR=1.459,95%可信区间为1.022-2.082,P=0.037)。结论BSG基因rs8259A>T多态性与中国汉族人群中非吸烟、非高血压个体慢性心衰的遗传易感性相关,携带rs8259T等位基因的个体慢性心衰的发病风险增加。目的Akt是一种丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶,也称蛋白激酶B,在调节心肌细胞生长、心肌血管新生、心肌细胞代谢和细胞凋亡等方面发挥重要作用。短期激活Akt可促进心肌的生理性肥大,保护心肌损伤,而长期激活Akt则导致心肌病理性肥大和心力衰竭。酪蛋白激酶2相互作用蛋白1(caseinkinase2-interactingprotein-1,CKIP-1)是近年来发现的Akt相互作用蛋白,可抑制Akt的活性,稳定表达CKIP-1可导致Akt失活,抑制细胞生长。因此,CKIP-1表达水平或功能改变可能在心力衰竭的发生发展中起重要作用。此部分研究旨在探讨CKIP-1多态性与中国长沙及周边地区汉族人群心力衰竭遗传易感性的关系。方法收集慢性心力衰竭病患者血液标本842例,收集性别年龄相匹配的健康对照人群血液标本803例；对Hapmap数据库中国人群CKIP-1基因位点的SNP数据进行分析；应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法对CKIp-1Pro21Ala(rs2306235C>G)多态性进行基因分型；χ2检验比较病例和对照人群中基因型分布的异同,Logistic回归分析确定CKIP-1Pro21Ala多态性与CHF易感性间的关联关系。结果健康对照人群中CKIP-1rs2306235多态位点CC.GC和GG基因型频率分别为82.3%、17.4%和0.28%,慢性心力衰竭病病例中该位点CC.GC和GG基因型频率分别为81.5%、17.2%和1.35%。该多态性位点基因型分布在病例和对照人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。χ2检验结果表明,病例和对照人群中该位点GG基因型的频率存在显著差异,痫例组rs2306235GG基因型频率显著高于对照人群(χ2=4.92,P=0.0231),但该基因型与CHF易感性的关系在校正CHF各风险因素后不明显。根据CHF患者是否伴有高血压进行分层分析发现,PrO21Ala多态性与伴有高血压的个体发生CHF的风险显著增加[校正后比值比(oddsratio,OR)=5.163,95%可信区间(confidenceinterval,Cl)=1.032-25.84,P=0.046);将心衰患者根据心功能等级分层后发现,rs2306235GG基因型频率在心衰Ⅲ/Ⅳ级患者中显著升高(OR=6.262,95％CI=1.32-29.62,P=0.0172).但二元logistic回归分析总体人群和分层研究后的结果,在经年龄、性别、吸烟、饮酒、高血压、糖尿病以及高脂血症校正后均无显著意义(P>0.05)。结论1)CKIP-1,Pro21Ala多态性突变等位基因21A1a在中国健康人群中的频率为10.0%,属常见多态性2)CKIP-1,Pro21Ala多态性与中国长沙地区人群合并高血压个体的慢性心力衰竭遗传易感性相关,突变等位基因纯合子个体患慢性心衰的风险增加。
【作者】郑杰；
【导师】李元建；
【作者基本信息】中南大学，药学，2013，博士
【关键词】BSG/CD147；单核苷酸多态性(SNP)；标签SNP(tagSNP)；连锁不平衡(LD)；中国人群；单核苷酸多态性；慢性心力衰竭；心力衰竭；CKIP-1；遗传易感性；

【参考文献】
[1]刘爽.纤维增强空心玻璃微珠/环氧树脂复合材料力学性能研究[D].燕山大学,工程力学,2014,硕士.
[2]鲍春晖.债务人异议之诉制度探究[D].华中师范大学,诉讼法学,2013,硕士.
[3]刘晓露.高墩大跨连续刚构桥稳定性分析[D].重庆交通大学,桥梁与隧道工程,2012,硕士.
[4]李栗.谈GIS技术在消防决策支持系统中的应用[J].消防技术与产品信息,2004,12:50-52.
[5]俞前.中国国际航空西南公司网络营销方案研究[D].四川大学,2003.
[6]汪平,顾伟康,杜旭东,周开凤.地震资料精细解释和储层横向预测在滚动勘探开发中的应用[J].石油地球物理勘探,2004,S1:153-157+170.
[7]程逊.独立学院大学生思想政治教育工作研究[D].西安电子科技大学,思想政治教育,2013,硕士.
[8]许诚,王安平,徐贲.繁忙铁路干线调度集中调试开通方案的研究[J].铁道通信信号.2007(02)
[9]刘瑞娜.基于投诉业务流的KPI设计与应用[D].北京邮电大学,电子与通信工程（专业学位）,2013,硕士.
[10]李恒三.大电机启动时电网电压波动的计算方法[J].油田地面工程.1991(01)
[11]张灿淋,姚明海,童小龙,张何栋.一种新的基于KKT条件的错误驱动SVM增量学习算法[J].计算机系统应用,2014,01:144-148.
[12]孙倩.试论传统纤维艺术在现代设计艺术中的传承与发展[D].天津美术学院,设计艺术学,2012,硕士.
[13]许友权.核聚类算法研究及其在文本聚类中的应用[D].江苏科技大学,模式识别与智能系统,2014,硕士.
[14]高家奎.紧急避险设施内生命保障方案研究[D].西安科技大学,安全技术及工程,2013,硕士.
[15]黄会强.伪半固态挤压制备高体积分数SiCp/Al复合材料的性能研究[D].兰州理工大学,材料加工工程,2014,硕士.
[16]甘睿淼.中韩制造业产业内贸易影响因素研究[D].吉林大学,世界经济,2013,硕士.
[17]马文娟.基于ArcEngine的大东湖水环境信息管理系统设计与开发[D].华中科技大学,水利工程,2013,硕士.
[18]管涛.第16届男篮世锦赛中外男篮前锋得分能力的比较分析[D].河北师范大学,体育教育训练学,2012,硕士.
[19]毛志坚.预应力混凝土连续刚构桥横向拼接静力性能研究[D].长安大学,桥梁与隧道工程,2013,硕士.
[20]郭威.朝阳市龙城区城镇居民最低生活保障问题及对策研究[D].大连理工大学,公共管理（专业学位）,2013,硕士.
[21]郝园.基于CT图像的轮廓样条曲线建模关键技术研究[D].山东理工大学,机械电子工程,2013,硕士.
[22]田广成.中国服务型政府建设的路径选择[D].东北师范大学,行政管理,2012,硕士.
[23]付旭东.以碳纳米管为基体的紫杉醇靶向制剂及其抑瘤作用研究[D].郑州大学,外科学（专业学位）,2012,博士.
[24]郭娟.基于自适应聚类距离边界的高维检索算法研究[D].浙江工业大学,计算机应用技术,2012,硕士.
[25]李涛.二十一世纪初年（2001-2012）中国婚姻文化嬗变研究[D].首都师范大学,中国近现代史,2014,硕士.
[26]刘春平.益气活血除湿法治疗类风湿关节炎的临床研究[D].北京中医药大学,中医内科学,2013,硕士.
[27]李正萍.基于FPGA波控技术的研究与实现[D].南京理工大学,电子与通信工程,2012,硕士.
[28]王东升.日粮模式对瘤胃与后肠中生物胺生成的影响[D].南京农业大学,动物营养与饲料科学,2012,硕士.
[29]刘婉璐.基于模体的复杂网络测度量及社团结构检测算法[D].武汉理工大学,应用数学,2012,硕士.
[30]程玖兵,马在田,陶正喜,朱敏,方伍宝,孔祥宁.山前带复杂构造成像方法研究[J].石油地球物理勘探,2006,05:525-529+614+487.
[31]李瑶.法国DEVCOT棉花贸易公司物流关键绩效评价体系的设计及研究[D].东华大学,纺织工程（专业学位）,2014,硕士.
[32]余洪敏.解郁丸联合米氮平片对焦虑性失眠（肝郁气滞、心神失养型）的疗效观察[D].河北医科大学,中西医结合临床（专业学位）,2014,硕士.
[33]牛钰茹.群体性突发事件网络舆情的形成演变机制和应对策略[D].四川省社会科学院,新闻学,2014,硕士.
[34]王冬梅.中国物流业税收负担水平评价与优化研究[D].北京交通大学,2013.
[35]赵宇.玉米防衰增产化学调控的机制研究[D].河南农业大学,作物栽培学与耕作学,2012,硕士.
[36]陈世云.蜂针治疗类风湿关节炎临床有效性及安全性研究[D].广州中医药大学,针灸推拿学（专业学位）,2014,博士.
[37]张英.改善足底压力舒适性的高跟鞋中底垫研究[D].陕西科技大学,服装设计与工程,2013,硕士.
[38]严思琪.室内空间形态的情趣化研究[D].湖南师范大学,设计艺术学,2014,硕士.
[39]蔺琳.辱虐管理对企业环境绩效的影响机制研究[D].西南财经大学,人力资源管理,2014,博士.
[40]彭永革.中国航空动力机械研究所信息化规划研究[D].湖南大学,工商管理,2013,硕士.
[41]邱禄颖.公司社会责任与财务表现关系的实证分析[D].西南交通大学,金融学,2013,硕士.
[42]何轶彬.I～2C总线研究及其应用系统设计[D].河北大学,通信与信息系统,2003,硕士.
[43]詹余欢.国际立法视野下CSR研究[D].长安大学,经济法学,2013,硕士.
[44]谢胜利,田森平,谢振东.基于向量图分析的迭代学习控制新算法(英文)[J].自动化学报,2004,02:161-168.
[45]蓝天鸿.电源完整性前仿真工具设计[D].西安电子科技大学,电子与通信工程,2012,硕士.
[46]任毅.青少年足球运动员训练挫折心理成因研究[D].西南大学,体育教育训练学,2013,硕士.
[47]袁进军.超站仪检定技术研究[D].北京林业大学,2010.
[48]王璞,胡天跃,PaulMatheny.宽线技术在下扬子地区页岩气勘探中的应用[J].石油地球物理勘探,2014,04:634-640+1.
[49]霍美霞.山姜素体外体内抗炎作用研究[D].吉林大学,基础兽医学,2013,硕士.
[50]利胜.铁基氧化物功能纳米材料的制备与性能研究[D].内蒙古师范大学,凝聚态物理,2013,硕士.