BRCA1相关基因单核苷酸多态性与三阴性乳腺癌易感性的研究

【摘要】第一部分BRCA1相关基因单核苷酸多态性与三阴性乳腺癌易感性的研究目的乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,乳腺癌易感基因1(breastcancertype1susceptibilityprotein,BRCA1)是乳腺癌中被广泛深入研究的肿瘤易感基因之一。携带有突变型BRCA1基因的女性罹患乳腺癌的风险高于携带野生型BRCA1基因的妇女。分子流行病学的研究发现,BRCA1基因的突变与三阴性乳腺癌的发生密切相关。BRCA1蛋白通过与蛋白复合体组成蛋白复合物发挥功能。本研究旨在研究BRCA1相关A蛋白复合物的相关基因的单核苷酸多态性与三阴性乳腺癌发病风险的关系,寻找和确定与汉族人群三阴性乳腺癌遗传易感性相关的基因型和单体型。方法本实验以上海地区汉族女性人群为研究对象。选取414例在2008年至2011年间在复旦大学附属肿瘤医院接受原发性乳腺癌手术的三阴性乳腺癌患者和354例健康妇女进行对照。收集她们的外周血基因组DNA,应用Massarray技术检测了病例组和对照组Abraxas,BRE,Rap80,BABAM1,BRCC36基因的37个SNP位点,随后分析了不同基因型与三阴性乳腺癌发病的相关性。结果三阴性乳腺癌患者Abraxas,BRE,Rap80,BRCC36基因的各检测位点多态性分布与正常对照组没有显著差异。BABAM1的SNP位点rs7250266突变的G等位基因在三阴性乳腺癌患者中频率显著低于在正常女性中的频率(p<0.01)。基因分型显示,rs7250266位点的CC、GC、GG三种基因型在三阴性乳腺癌和对照组的分布频率有显著差异(P=0.03),与携带CC基因型的个体比较,携带GC型的个体的三阴性乳腺癌的发病风险显著降低(GC:OR=0.70,95%CI(0.51-0.97),GG:OR=0.4895%CI(0.21-1.07))。对MAF超过1%的SNP的单体型分析显示：和主要单体型相比,单体型rs7250266(G)/rs2278256(G)/rs144376330(C)/rs10403581(C)/rs3745185(G)携带者及单体型rs7250266(G)/rs2278256(G)/rs144376330(C)/rs10403581(A)/rs3745185(G)携带者的三阴性乳腺癌患病风险较低。BABAM1基因的rs7250266的单核苷酸多态性与中国上海地区妇女的三阴性乳腺癌发病风险相关,其突变型等位基因携带者罹患三阴性乳腺癌的风险低于野生型等位基因携带者。单体型分析也证实BABAM1基因的不同单体型间三阴性乳腺癌发病风险不同。第二部分BABAM1基因的胚系突变和体细胞突变检测及rs8170对于BABAM1与BRCA1相关A蛋白复合物中其他基因相互作用的影响分析目的第一部分研究发现BABAM1基因的单核苷酸多态性与三阴性乳腺癌易感性相关,我们进一步探索了中国人群中BABAM1基因的胚系突变情况,并检测了肿瘤组织中BABAM1基因的体细胞突变情况。我们同时探索了rs8170对于BABAM1蛋白与BRCA1相关A蛋白复合物其他蛋白(Abraxas、Rap80、BRCC36)间的相互作用的影响。方法随机抽取140例原发性乳腺癌患者的基因组DNA样本和100例原发性乳腺癌肿瘤细胞DNA,进行BABAM1基因外显子和外显子内含子结合区域的PCR,测序检测。对转染了BABAM1基因表达和突变体质粒载体爵细胞利用免疫共沉淀方法获得的BRCA1相关A蛋白复合物,并使用Westernblot检验Rap80、BRE、BRCC36、Abraxas蛋白与BABAM1蛋白结合情况。结果发现了两个文献没有报道过的BABAM1基因组胚系突变,一个位于两号外显子,一个位于3’UTR。同时发现了一个肿瘤组织体细胞突变,位于七号外显子。我们发现BABAM1缺失了羧基端的299-329aa的结构会导致其与Rap80、Abraxas、BRCC36、BRE的结合能力的降低。而缺失了其他部位氨基酸的BABAM1与上述其他BRCA1相关蛋白的结合能力没有显著改变。rs8170恰巧位于第9号外显子区域,功能预测发现其突变将干扰BABAM1的mRNA的剪切,从而使BABAM1蛋白丢失其羧基端的序列,从而影响BABAM1蛋白与其他蛋白的结合。结论BABAM1羧基端的299-329aa是与Rap80、BRE、BRCC36、Abraxas这些蛋白结合的部位。其突变可导致BRCA1相关A蛋白复合物的功能异常。第三部分二十年内中国淋巴结阴性乳腺癌中肿瘤细胞增殖情况的改变及其与预后的关系目的自1990年后,中国上海地区的乳腺癌的发病率迅速增长。国外已有研究表明：增殖情况是淋巴结阴性乳腺癌的重要预后因子。本研究探讨的是：是否在这二十年间上海地区妇女的乳腺癌增殖情况和其他生化指标也出现了改变,该变化是否与乳腺癌的预后相关。方法研究者连续选取了89例在1983-1986年间在复旦大学附属肿瘤医院接受手术且术后病理为淋巴结阴性、浸润性乳腺癌的患者和105例连续的在2002-2003年间被诊断乳腺癌的患者。我们对这些患者的蜡块进行调取,重新染色检验。这些患者的临床、病理情况,雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)、CK5/6、Ki67、磷酸化组蛋白3(PPH3)和人表皮生长因子受体2(HER2)表达情况和有丝分裂指数被观察、记录。结果中位79个月的随访显示,两组的无复发生存率没有差异。两组在年龄、肿瘤大小、Her2和CK5/6表达无差异。2002-2003的患者体重、有丝分裂指数、Ki67和PPH3表达高于八十年代组；2000年后患者肿瘤PR阴性的比例也高于八十年代组。结论2000年后患者的各肿瘤增殖指标都高于八十年代淋巴结阴性乳腺癌患者。但这两组患者的生存没有差异。
【作者】凌泓；
【导师】邵志敏；
【作者基本信息】复旦大学，肿瘤学，2013，博士
【关键词】单核苷酸多态性；三阴性乳腺癌；BRCA1基因；BRCA1相关蛋白复；合物A；

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