基因间长非编码RNA与中国人群食管鳞状细胞癌发生发展的关联研究

【摘要】第一部分LincRNA-uc002yug.2通过影响RUNX1的选择性剪切的机制促进食管鳞状细胞癌的发展研究表明，基因间长非编码RNA（LongintergenicnoncodingRNA，LincRNA）在癌症生物学中具有极其重要的调控作用，然而，LincRNA与食管鳞状细胞癌的关联却少有研究。本研究旨在通过搜索关于食管鳞癌的全基因组关联研究（GWAS）报道所确定的食管鳞癌易感区段来筛选可能与食管鳞癌的发生发展有关联的LincRNA，进一步研究这些候选lincRNA与食管鳞癌的罹患风险以及预后之间的关联。为此，我们分别在来自中国东部和南部人群的共684例食管鳞癌患者中进行了一个两中心的独立病例研究，而且得到了一致的结果：LincRNA-uc002yug.2在食管鳞癌组织中普遍表达水平较高，是癌旁组织中表达水平的3.63倍，而其它候选LincRNA在食管鳞癌和癌旁组织中的表达水平并没有显著差异。而且LincRNA-uc002yug.2的表达与食管鳞癌的预后显著相关，LincRNA-uc002yug.2高表达的个体预后明显较差（HR=2.61;95%CI=1.50-3.78）。然后我们通过一系列的生化实验进一步研究了LincRNA-uc002yug.2在食管鳞癌发展过程中所发挥的功能，结果发现，LincRNA-uc002yug.2可以帮助选择性剪切因子结合到RUNX1基因上以促进RUNX1基因的选择性剪接，产生更多的具有促癌作用的变体RUNX1a，并进一步抑制具有抑癌功能的CEBPα基因的表达，从而促进细胞的增殖和肿瘤的生长。根据这些研究结果，我们可以知道LincRNA-uc002yug.2可能通过参与RUNX1基因的选择性剪切的机制来促进食管鳞癌的高频发生和不良预后。第二部分位于LincRNA-uc003opf.1上的功能性遗传变异与中国人群食管鳞状细胞癌易感性相关食管鳞状细胞癌的发生发展是一个多因素共同作用的过程，而且全基因组关联研究已经确定了遗传变异与食管鳞癌的关联。本研究的目的就是要检测位于基因间长非编码RNA（LincRNA）上的遗传变异，即单核苷酸多态（Singlenucleoidpolymorphism,SNP）与中国人群食管鳞癌易感性的关联。我们搜寻了位于食管鳞癌易感区段的LincRNA的外显子区域的所有可能有功能的多态，并且进行了一个两中心的独立病例对照研究，最终共有52个候选多态位点在来自中国东部和南部人群的共1493例食管鳞癌患者和1553例正常对照者中进行了基因分型。结果发现，只有位于LincRNA-uc003opf.1外显子区域的一个单核甘酸多态（rs11752942A>G）与食管鳞癌罹患风险降低显著相关，携带rs11752942GG基因型的个体罹患食管鳞癌的风险较携带rs11752942AA基因型的个体低0.55倍（95%CI=0.43-0.71）。生物化学分析进一步表明，rs11752942G等位基因的存在产生了micro-RNA-149*的结合位点，导致LincRNA-uc003opf.1表达水平降低，从而抑制了细胞的增殖和肿瘤的生长。这些研究结果表明，位于LincRNA-uc003opf.1外显子上的多态rs11752942A>G可能在食管鳞癌的发展过程中起到了遗传修饰的作用。
【作者】武宏春；
【导师】周翊峰；
【作者基本信息】苏州大学，遗传学，2014，硕士
【关键词】食管鳞状细胞癌；预后；基因间长非编码RNA；选择性剪切；易感性；中国人群；

【参考文献】
[1]白兰.高速公路多车道交通流诱导策略的研究[D].长安大学,控制理论与控制工程,2014,硕士.
[2]魏东霞.在中学阶段开展智能机器人教学研究[D].河北师范大学,现代教育技术,2013,硕士.
[3]艾萍,倪伟新.我国水文数据挖掘技术研究的回顾与展望[J].计算机工程与应用,2003,28:13-17.
[4]郭林杰.大型油轮辅锅炉系统的建模与仿真研究[D].大连海事大学,船舶与海洋工程,2013,硕士.
[5]陈欢.自然循环太阳能蒸汽发生系统传热特性实验研究[D].浙江大学,工程热物理,2013,硕士.
[6]杨扬.液压挖掘机工作装置动力学分析与控制系统研究[D].哈尔滨工业大学,机械设计及理论,2013,硕士.
[7]吕晋.视频监控系统中目标检测与阴影抑制算法研究与实现[D].东北大学,模式识别与智能系统,2010,硕士.
[8]王丽娇.建构主义视角下初中语文的送别诗阅读教学[D].渤海大学,学科教学（专业学位）,2014,硕士.
[9]杨光煜,刘敬.利用客户关系管理推进金融行业的发展[J].生产力研究,2005,04:60-62.
[10]倪程捷,房鑫炎,赵文恺,区伟健,赵彤彤.基于图论的移动应急电源孤岛划分及最优接入点搜索[J].电力系统自动化,2015,06:34-40.
[11]李亚丹.新型微反应器制备纳米二氧化硅粉体[D].北京化工大学,化学工程与技术,2013,硕士.
[12]马洁.链型有机分子电子输运性质的研究[D].鲁东大学,原子与分子物理,2014,硕士.
[13]孙彪.不同年代大豆品种伤流液重量的变化及其与地上部分生物量的关系[D].吉林农业大学,作物栽培学与耕作学,2012,硕士.
[14]汪蓓.“把”字句的核心语义及其对外汉语教学[D].华中科技大学,汉语国际教育,2013,硕士.
[15]张志刚.节理岩体强度确定方法及其各向异性特征研究[D].北京交通大学,2007.
[16]童娴.锚定条件下干扰方式对大学生数量估计的影响及ERP研究[D].苏州大学,基础心理学,2013,硕士.
[17]刘金春.规模化猪场生产管理与疫病防控模式探索[D].江西农业大学,兽医,2012,硕士.
[18]朱莎.发泡水泥复合屋面板负风压承载力的理论分析与试验研究[D].北京交通大学,2014.
[19]房忠雪.炔丙醇与二硫缩烯酮的碳/杂环化反应[D].东北师范大学,有机化学,2014,博士.
[20]吴春玉.政府决策信息可视化及信息增值[J].情报杂志,2005,11:69-71.
[21]冯科.辽圣宗朝统治阶层中的契汉矛盾[D].内蒙古大学,中国古代史,2014,硕士.
[22]贝永燕.软脂酸三甲基壳聚糖聚合物包载去氢骆驼蓬碱肝肿瘤靶向自组装胶束研究[D].苏州大学,药剂学,2013,硕士.
[23]李允博,张成良.1.6Tbit/s与800Gbit/s光波分复用系统(WDM)技术要求[J].电信网技术.2003(01)
[24]刘荣征.初中生运用英语学习策略情况的调查与思考[D].华中师范大学,学科教学论,2003,硕士.
[25]王保民.基于安全状态信息库的入侵检测系统研究[D].河北大学,2004.
[26]孔祥超.鄂尔多斯盆地华庆地区长8_1沉积相特征研究[D].成都理工大学,地质学,2013,硕士.
[27]王振龙,朱文琦,亢大麟.网格技术与统计未来[J].统计研究,2005,11:36-38.
[28]支行.我国地方财政投资软预算约束问题成因研究[D].北京交通大学,2014.
[29]阿继凯.DMRG方法的发展及在一维扩展t-J模型中的应用[D].兰州大学,理论物理,2013,硕士.
[30]赵强伟.Web Service下数据传输技术的研究[D].华中科技大学,计算机技术,2013,硕士.
[31]衣梦霏.中国援非对中非贸易的影响[D].东北财经大学,国际贸易学,2012,硕士.
[32]顾孟钧.基于D-S证据理论的信息系统风险评估方法研究[D].浙江工业大学,2009.
[33]杨善林,丁帅,褚伟.一种基于效用和证据理论的可信软件评估方法[J].计算机研究与发展,2009,07:1152-1159.
[34]王栋栋.热处理工艺对M42/D6A双金属带锯条组织性能的影响[D].湖南大学,材料工程,2014,硕士.
[35]李峰.从谐音原理看音列与调式音阶[D].武汉音乐学院,音乐与舞蹈学,2014,硕士.
[36]范永刚.面向集合的MapPartition计算模型的研究与实现[D].西安电子科技大学,计算机软件与理论,2012,硕士.
[37]谭亚君.突变型P53与胃癌多重耐药性关系的研究[D].浙江大学,临床检验诊断学,2004,硕士.
[38]罗明.湖南清代文教建筑研究[D].湖南大学,建筑设计及其理论,2014,博士.
[39]何丽华.奈必洛尔药动学及其手性代谢机制研究[D].中南大学,药学,2014,博士.
[40]金磊.从“小康安全”谈住宅安康设计[J].中国建设信息.2003(03)
[41]张梅芳.成人高等函授学员学习效果的研究[D].南京师范大学,成人教育学,2012,硕士.
[42]王晓茹,魏星,张鹏.基于超导磁储能的电力系统机电扰动传播控制[J].电力系统自动化,2013,01:155-160.
[43]唐建维.关于对朱华先生“西双版纳热带山地雨林的植物多样性研究的一些问题讨论”一文中有关问题的说明[J].植物生态学报,2006,01:187-189.
[44]吴霞.蛋白质序列比较中的图形表示及其相似性分析[D].大连理工大学,计算数学,2004,硕士.
[45]张清哲,辛言君,马东,包南,公丕成.无机离子对石墨烯/TiO_2纳米管阵列光电极光催化性能影响[J].环境工程学报,2014,10:4239-4243.
[46]蒋四华.加入世贸组织对我国乡镇企业的影响及对策研究[D].中国农业大学,种植业,2004,硕士.
[47]赵鹏.带有胎面花纹的轮胎三维有限元分析与泵气噪声的研究[D].北京化工大学,流体机械及工程,2013,硕士.
[48]常树民.金融业反洗钱问题研究[D].江西财经大学,经济法学,2004,硕士.
[49]王凯.间伐强度对河北平泉油松人工林林下植物的短期影响[D].北京林业大学,城市林业,2013,硕士.
[50]何建平,金萍.控制系统仿真和分析的一种解析方法[J].冶金自动化,1992,05:39-43+14.