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MD模拟研究生物小分子在跨膜环肽纳米管中的传输特性 02月26日

【摘要】论文包括两大部分。1.采用EMD、SMD模拟以及ABF方法,研究了三种生物小分子(O2、CO2和NH3)在跨膜环八肽纳米水通道中的传输特性。研究表明,NH3分子进出管口遇到的阻力最小,在通道中传输时与周围水分子以及管壁形成氢键的能力最强。除了管口位置,O2和CO2分子在管中很难与管壁发生氢键作用。直接氢键作用的同时,三种气体分子可以与管壁形成间接氢键作用—水桥。PMF曲线展示了通道内-pl […]